1
|
Bontoux C, Marcovich A, Goffinet S, Pesce F, Tanga V, Bohly D, Salah M, Washetine K, Messaoudi Z, Felix JM, Bonnetaud C, Wang L, Menon G, Berthet JP, Cohen C, Benzaquen J, Marquette CH, Lassalle S, Long-Mira E, Hofman V, Xerri L, Ilié M, Hofman P. The Need to Set up a Biobank Dedicated to Lymphoid Malignancies: Experience of a Single Center (Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, University Côte d'Azur, Nice, France). J Pers Med 2023; 13:1076. [PMID: 37511690 PMCID: PMC10381579 DOI: 10.3390/jpm13071076] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 05/31/2023] [Revised: 06/26/2023] [Accepted: 06/27/2023] [Indexed: 07/30/2023] Open
Abstract
Several therapies to improve the management of lymphoma are currently being investigated, necessitating the development of new biomarkers. However, this requires high-quality and clinically annotated biological material. Therefore, we established a lymphoma biobank including all available biological material (tissue specimens and matched biological resources) along with associated clinical data for lymphoma patients diagnosed, according to the WHO classification, between 2005 and 2022 in the Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Nice, France. We retrospectively included selected cases in a new collection at the Côte d'Azur Biobank, which contains 2150 samples from 363 cases (351 patients). The male/female ratio was 1.3, and the median age at diagnosis was 58 years. The most common lymphoma types were classical Hodgkin lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, and extra-nodal marginal zone lymphoma of MALT tissue. The main sites of lymphoma were the mediastinum, lymph node, Waldeyer's ring, and lung. The Côte d'Azur Biobank is ISO 9001 and ISO 20387 certified and aims to provide high quality and diverse biological material to support translational research projects into lymphoma. The clinico-pathological data generated by this collection should aid the development of new biomarkers to enhance the survival of patients with lymphoid malignancies.
Collapse
Affiliation(s)
- Christophe Bontoux
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging of Nice (IRCAN), Inserm U1081, CNRS UMR7284, Université Côte d'Azur, CHU de Nice, CEDEX 2, 06107 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Aubiège Marcovich
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Samantha Goffinet
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Florian Pesce
- Department of Biopathology and Tumor Immunology, Institut Paoli-Calmettes, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, INSERM U1068, Centre National de la Recherche Scientifique UMR 7258, Aix-Marseille University, UM105, CEDEX 9, 13273 Marseille, France
| | - Virginie Tanga
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Doriane Bohly
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Myriam Salah
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Kevin Washetine
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Zeineb Messaoudi
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Jean-Marc Felix
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Christelle Bonnetaud
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Lihui Wang
- Haemato-Oncology Diagnostic Service, Cheshire & Merseyside Cancer Network, Liverpool University Hospitals NHS Foundation Trust, CSSB Building Level 4, Vernon Street, Liverpool L7 8YE, UK
| | - Geetha Menon
- Haemato-Oncology Diagnostic Service, Cheshire & Merseyside Cancer Network, Liverpool University Hospitals NHS Foundation Trust, CSSB Building Level 4, Vernon Street, Liverpool L7 8YE, UK
| | - Jean-Philippe Berthet
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Department of Thoracic Surgery, FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Charlotte Cohen
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Department of Thoracic Surgery, FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Jonathan Benzaquen
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Department of Pneumology, FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Charles-Hugo Marquette
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Department of Pneumology, FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Sandra Lassalle
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging of Nice (IRCAN), Inserm U1081, CNRS UMR7284, Université Côte d'Azur, CHU de Nice, CEDEX 2, 06107 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Elodie Long-Mira
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging of Nice (IRCAN), Inserm U1081, CNRS UMR7284, Université Côte d'Azur, CHU de Nice, CEDEX 2, 06107 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Veronique Hofman
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging of Nice (IRCAN), Inserm U1081, CNRS UMR7284, Université Côte d'Azur, CHU de Nice, CEDEX 2, 06107 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Luc Xerri
- Department of Biopathology and Tumor Immunology, Institut Paoli-Calmettes, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, INSERM U1068, Centre National de la Recherche Scientifique UMR 7258, Aix-Marseille University, UM105, CEDEX 9, 13273 Marseille, France
| | - Marius Ilié
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging of Nice (IRCAN), Inserm U1081, CNRS UMR7284, Université Côte d'Azur, CHU de Nice, CEDEX 2, 06107 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| | - Paul Hofman
- Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging of Nice (IRCAN), Inserm U1081, CNRS UMR7284, Université Côte d'Azur, CHU de Nice, CEDEX 2, 06107 Nice, France
- FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, CEDEX 1, 06001 Nice, France
- Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, CEDEX 1, 06001 Nice, France
| |
Collapse
|