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Carelli V, Achilli A, Valentino ML, Rengo C, Semino O, Pala M, Olivieri A, Mattiazzi M, Pallotti F, Carrara F, Zeviani M, Leuzzi V, Carducci C, Valle G, Simionati B, Mendieta L, Salomao S, Belfort R, Sadun AA, Torroni A. Haplogroup effects and recombination of mitochondrial DNA: novel clues from the analysis of Leber hereditary optic neuropathy pedigrees. Am J Hum Genet 2006; 78:564-74. [PMID: 16532388 PMCID: PMC1424694 DOI: 10.1086/501236] [Citation(s) in RCA: 135] [Impact Index Per Article: 7.5] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [MESH Headings] [Grants] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 12/08/2005] [Accepted: 01/13/2006] [Indexed: 11/03/2022] Open
Abstract
The mitochondrial DNA (mtDNA) of 87 index cases with Leber hereditary optic neuropathy (LHON) sequentially diagnosed in Italy, including an extremely large Brazilian family of Italian maternal ancestry, was evaluated in detail. Only seven pairs and three triplets of identical haplotypes were observed, attesting that the large majority of the LHON mutations were due to independent mutational events. Assignment of the mutational events into haplogroups confirmed that J1 and J2 play a role in LHON expression but narrowed the association to the subclades J1c and J2b, thus suggesting that two specific combinations of amino acid changes in the cytochrome b are the cause of the mtDNA background effect and that this may occur at the level of the supercomplex formed by respiratory-chain complexes I and III. The families with identical haplotypes were genealogically reinvestigated, which led to the reconnection into extended pedigrees of three pairs of families, including the Brazilian family with its Italian counterpart. The sequencing of entire mtDNA samples from the reconnected families confirmed the genealogical reconstruction but showed that the Brazilian family was heteroplasmic at two control-region positions. The survey of the two sites in 12 of the Brazilian subjects revealed triplasmy in most cases, but there was no evidence of the tetraplasmy that would be expected in the case of mtDNA recombination.
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Affiliation(s)
- Valerio Carelli
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Alessandro Achilli
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Maria Lucia Valentino
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Chiara Rengo
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Ornella Semino
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Maria Pala
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Anna Olivieri
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Marina Mattiazzi
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Francesco Pallotti
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Franco Carrara
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Massimo Zeviani
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Vincenzo Leuzzi
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Carla Carducci
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Giorgio Valle
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Barbara Simionati
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Luana Mendieta
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Solange Salomao
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Rubens Belfort
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Alfredo A. Sadun
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
| | - Antonio Torroni
- Dipartimento di Scienze Neurologiche, Università di Bologna, Bologna; Doheny Eye Institute, Keck/University of Southern California School of Medicine, Los Angeles; Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia, Pavia, Italy; Department of Neurology, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York; Division of Molecular Neurogenetics, National Neurological Institute “Carlo Besta,” Milan; Dipartimenti di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’ Età Evolutiva and Medicina Sperimentale, Università di Roma “La Sapienza,” Rome; Centro Ricerca Interdipartimentale Biotecnologie Innovative, Università di Padua, Padua, Italy; and Departamento de Oftalmologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo
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