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Elias DE, Santos MR, Campaña H, Poletta FA, Heisecke SL, Gili JA, Ratowiecki J, Cosentino VR, Uranga R, Málaga DR, Oliveira AB, Brusius-Facchin AC, Saleme C, Rittler M, Krupitzki HB, Camelo JSL, Gimenez LG. Gene-environment interactions and preterm birth predictors: A Bayesian network approach. Genet Mol Biol 2024; 46:e20230090. [PMID: 38285431 PMCID: PMC10804443 DOI: 10.1590/1678-4685-gmb-2023-0090] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/27/2023] [Accepted: 11/20/2023] [Indexed: 01/30/2024] Open
Abstract
Preterm birth (PTB) is the main condition related to perinatal morbimortality worldwide. The aim of this study was to identify gene-environment interactions associated with spontaneous PTB or its predictors. We carried out a retrospective case-control study including parental sociodemographic and obstetric data as well as newborn genetic variants of 69 preterm and 61 at term newborns born at a maternity hospital from Tucumán, Argentina, between 2005 and 2010. A data-driven Bayesian network including the main PTB predictors was created where we identified gene-environment interactions. We used logistic regressions to calculate the odds ratios and confidence intervals of the interactions. From the main PTB predictors (nine exposures and six genetic variants) we identified an interaction between low neighbourhood socioeconomic status and rs2074351 (PON1, genotype GG) variant that was associated with an increased risk of toxoplasmosis (odds ratio 12.51, confidence interval 95%: 1.71 - 91.36). The results of this exploratory study suggest that structural social disparities could influence the PTB risk by increasing the frequency of exposures that potentiate the risk associated with individual characteristics such as genetic traits. Future studies with larger sample sizes are necessary to confirm these findings.
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Affiliation(s)
- Dario E. Elias
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
| | - Maria R. Santos
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Comisión de Investigaciones Científicas, Buenos Aires,
Argentina
- Instituto Multidisciplinario de Biología Celular, Buenos Aires,
Argentina
| | - Hebe Campaña
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Comisión de Investigaciones Científicas, Buenos Aires,
Argentina
| | - Fernando A. Poletta
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP),
CEMIC-CONICET, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina
| | - Silvina L. Heisecke
- Dirección de Investigación, CEMIC-CONICET, Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
| | - Juan A. Gili
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Instituto Académico Pedagógico de Ciencias Humanas, Universidad
Nacional de Villa María, Córdoba, Argentina
| | - Julia Ratowiecki
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
| | - Viviana R. Cosentino
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Hospital Interzonal General de Agudos Luisa C. de Gandulfo, Buenos
Aires, Argentina
| | - Rocio Uranga
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Hospital San Juan de Dios, Buenos Aires, Argentina
| | - Diana Rojas Málaga
- Serviço de Genética Médica, Hospital de Clínicas de Porto Alegre
(HCPA), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brasil
| | - Alice Brinckmann Oliveira
- Serviço de Genética Médica, Hospital de Clínicas de Porto Alegre
(HCPA), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brasil
| | - Ana Carolina Brusius-Facchin
- Serviço de Genética Médica, Hospital de Clínicas de Porto Alegre
(HCPA), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brasil
| | - César Saleme
- Instituto de Maternidad y Ginecología Nuestra Señora de las
Mercedes, Tucumán, Argentina
| | - Mónica Rittler
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Hospital Materno Infantil Ramón Sardá, Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
| | - Hugo B. Krupitzki
- Dirección de Investigación, CEMIC-CONICET, Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Instituto Universitario, Centro de Educación Médica e
Investigaciones Clínicas (CEMIC-IUC), Ciudad Autónoma de Buenos Aires,
Argentina
| | - Jorge S. Lopez Camelo
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP),
CEMIC-CONICET, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina
| | - Lucas G. Gimenez
- Estudio Colaborativo Latino Americano de Malformaciones Congénitas
(ECLAMC), Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas-Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (CEMIC-CONICET), Ciudad Autónoma de Buenos
Aires, Argentina
- Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP),
CEMIC-CONICET, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina
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