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Manceau G, Imbeaud S, Thiébaut R, Liébaert F, Fontaine K, Rousseau F, Génin B, Le Corre D, Didelot A, Vincent M, Bachet JB, Chibaudel B, Bouché O, Landi B, Bibeau F, Leroy K, Penault-Llorca F, Van Laethem JL, Demetter P, Tejpar S, Rossi S, Mosakhani N, Osterlund P, Ristamäki R, Sarhadi V, Knuutila S, Boige V, André T, Laurent-Puig P. Hsa-miR-31-3p expression is linked to progression-free survival in patients with KRAS wild-type metastatic colorectal cancer treated with anti-EGFR therapy. Clin Cancer Res 2014; 20:3338-47. [PMID: 24771647 DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-13-2750] [Citation(s) in RCA: 79] [Impact Index Per Article: 7.9] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 12/12/2022]
Abstract
PURPOSE To identify microRNAs (miRNA) that predict response to anti-EGFR antibodies in patients with wild-type KRAS metastatic colorectal cancer (mCRC). EXPERIMENTAL DESIGN miRNA profiling was performed in a training set of 87 patients with mCRC refractory to chemotherapy treated with anti-EGFR antibodies. This included 33 fresh-frozen (FF) and 35 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples retrospectively collected and 19 prospectively collected FF samples. An independent validation cohort consisting of 19 FF and 26 FFPE prospectively collected samples from patients with mCRC treated with anti-EGFR antibodies was used to confirm our findings. RESULTS After screening the expression of 1,145 miRNAs in FF samples from the training set, we identified that hsa-miR-31-3p expression level was significantly associated with progression-free survival (PFS). Statistical models based on miRNA expression discriminated between high and low risk of progression for both FF and FFPE samples. These models were confirmed in the validation cohort for both FF [HR, 4.1; 95% confidence interval (CI), 1.1-15.3; P < 0.04] and FFPE samples (HR, 2.44; 95% CI, 1.1-5.4; P = 0.028). The percentage of variation of RECIST criteria in the validation series was significantly associated with the expression level of hsa-miR-31-3p (r(2) = 0.49; P = 0.0035) and risk status determined by hsa-miR-31-3p expression level (P = 0.02, Kruskal-Wallis rank test). Nomograms were built and validated to predict PFS-depending on hsa-miR-31-3p expression level. Following in vitro studies, we identified 47 genes regulated by hsa-miR-31-3p. CONCLUSION Hsa-miR-31-3p seems to be a new mCRC biomarker whose expression level allows for the identification of patients with wild-type KRAS mCRC who are more likely to respond to anti-EGFR therapy.
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Affiliation(s)
- Gilles Manceau
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
| | - Sandrine Imbeaud
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Raphaële Thiébaut
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - François Liébaert
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Karine Fontaine
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Francis Rousseau
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Bérengère Génin
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Delphine Le Corre
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Audrey Didelot
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Marc Vincent
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Jean-Baptiste Bachet
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Benoist Chibaudel
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Olivier Bouché
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Bruno Landi
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Frédéric Bibeau
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Karen Leroy
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Frédérique Penault-Llorca
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Jean-Luc Van Laethem
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Pieter Demetter
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Sabine Tejpar
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Simona Rossi
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Neda Mosakhani
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Pia Osterlund
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Raija Ristamäki
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Virinder Sarhadi
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Sakari Knuutila
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
| | - Valérie Boige
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
| | - Thierry André
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, Finland
| | - Pierre Laurent-Puig
- Authors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Saint-Antoine; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Européen Georges Pompidou, service d'Hépato-Gastro-Entérologie et d'Oncologie Digestive; Université Paris-Est Créteil; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Henri Mondor, Créteil; Department of Medicine, Institut Gustave Roussy, Villejuif; and Department of Biology, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, European Georges Pompidou, Paris; Université de Reims Champagne-Ardenne; Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims; Service d'Anatomo-Pathologie, Centre Val d'Aurelle Paul-Lamarque, Montpellier; Université Clermont-Ferrand, Centre Jean Perrin, Clermont-Ferrand, France; Department of Gastroenterology, GI Cancer Unit; Department of Pathological Anatomy, Erasme University Hospital, Brussels; Digestive Oncology Unit, University Hospital Gasthuisberg, Leuven, Belgium; Bioinformatics Core Facility, Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland; Haartman Institute, University of Helsinki; Department of Oncology, Helsinki University Central Hospital and Helsinki University; HUSLAB, Department of Pathology and Genetic Laboratory, Helsinki; and Department of Oncology and Radiotherapy, Turku University Hospital, Turku, FinlandAuthors' Affiliations: Université Paris Sorbonne Cité; INSERM UMR-S775 Bases Moléculaires de la réponse aux xénobiotiques; INSERM UMR-S674 Genomique Fonctionnelle des Tumeurs; Integragen S.A., Evry; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Pitié Salpétrière; Université Pierre et Marie Curie; Assistance Publique-Hôpit
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