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Morel G, Ernest S, Serey-Gaut M, Jonard L, Balogoun AR, Parodi M, Loundon N, Achard S, Marlin S. RIPOR2: A new gene of non-syndromic cochleovestibular dysfunction, discrepancy between human pathology and animal models. Clin Genet 2023; 104:669-673. [PMID: 37864412 DOI: 10.1111/cge.14436] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 07/26/2023] [Revised: 09/22/2023] [Accepted: 09/28/2023] [Indexed: 10/22/2023]
Abstract
Cochleovestibular dysfunctions are rare conditions misrecognized. A homozygous pathogenic variation c.1561C > T (p.Arg521*) in RIPOR2 (RHO family interacting cell polarization regulator 2) has been identified by WES in Tunisian siblings suffering from congenital bilateral profound hearing and vestibular dysfunctions. In contrast to the vestibular areflexia observed in our patients, deaf Ripor2 KO mouse model and our zebrafish model have normal vestibular function.
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Affiliation(s)
- Godelieve Morel
- Centre de Référence «Surdités Génétiques», Fédération de Génétique; Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Service de Génétique Médicale, CHU Felix Guyon, France
| | - Sylvain Ernest
- Laboratory of Embryology and Genetics of Malformations, Imagine Institute, INSERM UMR 1163, Université de Paris, Paris, France
| | - Margaux Serey-Gaut
- Centre de Référence «Surdités Génétiques», Fédération de Génétique; Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Centre de Recherche en Audiologie (CREA), Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Laurence Jonard
- Centre de Référence «Surdités Génétiques», Fédération de Génétique; Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Centre de Recherche en Audiologie (CREA), Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Abeke Ralyath Balogoun
- Centre de Référence «Surdités Génétiques», Fédération de Génétique; Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Centre de Recherche en Audiologie (CREA), Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Marine Parodi
- Service d'ORL Pédiatrique et de Chirurgie Cervico-Faciale, Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Natalie Loundon
- Centre de Référence «Surdités Génétiques», Fédération de Génétique; Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Centre de Recherche en Audiologie (CREA), Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Service d'ORL Pédiatrique et de Chirurgie Cervico-Faciale, Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Sophie Achard
- Centre de Référence «Surdités Génétiques», Fédération de Génétique; Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Service d'ORL Pédiatrique et de Chirurgie Cervico-Faciale, Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Sandrine Marlin
- Centre de Référence «Surdités Génétiques», Fédération de Génétique; Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
- Laboratory of Embryology and Genetics of Malformations, Imagine Institute, INSERM UMR 1163, Université de Paris, Paris, France
- Centre de Recherche en Audiologie (CREA), Hôpital Necker-Enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
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Chen Y, Zhu Q, Wang Y, Dai X, Chen P, Chen A, Zhou S, Dai C, Zhao S, Xiao S, Lan Q. Case Report: A novel LHFPL3::NTRK2 fusion in dysembryoplastic neuroepithelial tumor. Front Oncol 2022; 12:1064817. [PMID: 36531047 PMCID: PMC9752035 DOI: 10.3389/fonc.2022.1064817] [Citation(s) in RCA: 1] [Impact Index Per Article: 0.5] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Grants] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 10/08/2022] [Accepted: 11/17/2022] [Indexed: 07/30/2023] Open
Abstract
Neurotrophic tyrosine receptor kinase (NTRK) rearrangements are oncogenic drivers of various types of adult and pediatric tumors, including gliomas. However, NTRK rearrangements are extremely rare in glioneuronal tumors. Here, we report a novel NTRK2 rearrangement in a 24-year-old female with dysembryoplastic neuroepithelial tumor (DNT), a circumscribed WHO grade I benign tumor associated with epilepsy. By utilizing targeted RNA next-generation sequencing (NGS), fluorescence in situ hybridization (FISH), reverse transcriptase PCR (RT-PCR), and Sanger sequencing, we verified an in-frame fusion between NTRK2 and the lipoma HMGIC fusion partner-like 3 (LHFPL3). This oncogenic gene rearrangement involves 5' LHFPL3 and 3' NTRK2, retaining the entire tyrosine kinase domain of NTRK2 genes. Moreover, the targeted DNA NGS analysis revealed an IDH1 (p.R132H) mutation, a surprising finding in this type of tumor. The pathogenic mechanism of the LHFPL3::NTRK2 in this case likely involves aberrant dimerization and constitutive activation of RTK signaling pathways.
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Affiliation(s)
- Yanming Chen
- Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, China
| | - Qing Zhu
- Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, China
| | - Ye Wang
- Heath Management Center, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, China
| | - Xiaoxiao Dai
- Department of Pathology, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, China
| | - Ping Chen
- Molecular Genetics Laboratory, Suzhou Sano Precision Medicine Ltd., Suzhou, China
| | - Ailin Chen
- Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, China
| | - Sujuan Zhou
- Molecular Genetics Laboratory, Suzhou Sano Precision Medicine Ltd., Suzhou, China
- Pathology and Pathophysiology, Soochow University Medical College, Suzhou, China
| | - Chungang Dai
- Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, China
| | - Shengbin Zhao
- Molecular Genetics Laboratory, Suzhou Sano Precision Medicine Ltd., Suzhou, China
| | - Sheng Xiao
- Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital, Boston, BS, United States
| | - Qing Lan
- Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou, China
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Heide S, Jacquemont ML, Cheillan D, Renouil M, Tallot M, Schwartz CE, Miquel J, Bintner M, Rodriguez D, Darcel F, Buratti J, Haye D, Passemard S, Gras D, Perrin L, Capri Y, Gérard B, Piton A, Keren B, Thauvin-Robinet C, Duffourd Y, Faivre L, Poe C, Pervillé A, Héron D, Thévenon J, Arnaud L, LeGuern E, La Selva L, Vetro A, Guerrini R, Nava C, Mignot C. GM3 synthase deficiency in non-Amish patients. Genet Med 2021; 24:492-498. [PMID: 34906476 DOI: 10.1016/j.gim.2021.10.007] [Citation(s) in RCA: 3] [Impact Index Per Article: 1.0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/11/2021] [Revised: 06/07/2021] [Accepted: 10/10/2021] [Indexed: 11/26/2022] Open
Abstract
PURPOSE Biallelic loss-of-function variants in ST3GAL5 cause GM3 synthase deficiency (GM3SD) responsible for Amish infantile epilepsy syndrome. All Amish patients carry the homozygous p.(Arg288Ter) variant arising from a founder effect. To date only 10 patients from 4 non-Amish families have been reported. Thus, the phenotypical spectrum of GM3SD due to other variants and other genetic backgrounds is still poorly known. METHODS We collected clinical and molecular data from 16 non-Amish patients with pathogenic ST3GAL5 variants resulting in GM3SD. RESULTS We identified 12 families originating from Reunion Island, Ivory Coast, Italy, and Algeria and carrying 6 ST3GAL5 variants, 5 of which were novel. Genealogical investigations and/or haplotype analyses showed that 3 of these variants were founder alleles. Glycosphingolipids quantification in patients' plasma confirmed the pathogenicity of 4 novel variants. All patients (N = 16), aged 2 to 12 years, had severe to profound intellectual disability, 14 of 16 had a hyperkinetic movement disorder, 11 of 16 had epilepsy and 9 of 16 had microcephaly. Other main features were progressive skin pigmentation anomalies, optic atrophy or pale papillae, and hearing loss. CONCLUSION The phenotype of non-Amish patients with GM3SD is similar to the Amish infantile epilepsy syndrome, which suggests that GM3SD is associated with a narrow and severe clinical spectrum.
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Affiliation(s)
- Solveig Heide
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Marie-Line Jacquemont
- Unité fonctionnelle de Génétique Médicale, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion, Saint-Pierre, France
| | - David Cheillan
- Service de Biochimie et Biologie Moléculaire, Centre de Biologie et de Pathologie Est, Hospices Civils de Lyon, Bron, France
| | - Michel Renouil
- Service de Pédiatrie, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion, Saint-Pierre, France
| | - Marilyn Tallot
- Service de Pédiatrie, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion, Saint-Pierre, France
| | | | - Juliette Miquel
- Unité Fonctionnelle de Dermatologie Pédiatrique, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion, Saint-Pierre, France
| | - Marc Bintner
- Service d'Imagerie Médicale, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion, Saint-Pierre, France
| | - Diana Rodriguez
- AP-HP.Sorbonne Université, Service de Neuropédiatrie & Centre de Référence de Neurogénétique, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France; INSERM U1141, FHU I2-D2, Paris, France
| | - Françoise Darcel
- Centre de Maladie Neurologiques Rares, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion, Saint-Pierre, France
| | - Julien Buratti
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Damien Haye
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Sandrine Passemard
- Service de Neuropédiatrie, Hôpital Robert Debré, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Nord-Université de Paris, Paris, France
| | - Domitille Gras
- Service de Neuropédiatrie, Hôpital Robert Debré, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Nord-Université de Paris, Paris, France
| | - Laurence Perrin
- Service de Génétique, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Robert Debré, Nord-Université de Paris, Paris, France
| | - Yline Capri
- Service de Génétique, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Robert Debré, Nord-Université de Paris, Paris, France
| | - Bénédicte Gérard
- Laboratoire de Diagnostic Génétique, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - Amélie Piton
- Laboratoire de Diagnostic Génétique, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - Boris Keren
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Christel Thauvin-Robinet
- Centre de Génétique et Centre de Référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs de l'Interrégion Est, Fédération Hospitalo-Universitaire Médecine TRANSLationnelle et Anomalies du Développement, Centre Hospitalier Universitaire Dijon, Equipe Genetics of Developmental Anomalies-INSERM UMR 1231, Dijon, France
| | - Yannis Duffourd
- Centre de Génétique et Centre de Référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs de l'Interrégion Est, Fédération Hospitalo-Universitaire Médecine TRANSLationnelle et Anomalies du Développement, Centre Hospitalier Universitaire Dijon, Equipe Genetics of Developmental Anomalies-INSERM UMR 1231, Dijon, France
| | - Laurence Faivre
- Centre de Génétique et Centre de Référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs de l'Interrégion Est, Fédération Hospitalo-Universitaire Médecine TRANSLationnelle et Anomalies du Développement, Centre Hospitalier Universitaire Dijon, Equipe Genetics of Developmental Anomalies-INSERM UMR 1231, Dijon, France
| | - Charlotte Poe
- Centre de Génétique et Centre de Référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs de l'Interrégion Est, Fédération Hospitalo-Universitaire Médecine TRANSLationnelle et Anomalies du Développement, Centre Hospitalier Universitaire Dijon, Equipe Genetics of Developmental Anomalies-INSERM UMR 1231, Dijon, France
| | - Anne Pervillé
- Service de Médecine Physique, Hôpital d'enfants de Saint-Denis, Saint-Denis, France
| | - Delphine Héron
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Julien Thévenon
- Centre de Génétique et Centre de Référence Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs de l'Interrégion Est, Fédération Hospitalo-Universitaire Médecine TRANSLationnelle et Anomalies du Développement, Centre Hospitalier Universitaire Dijon, Equipe Genetics of Developmental Anomalies-INSERM UMR 1231, Dijon, France
| | - Lionel Arnaud
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Eric LeGuern
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Sorbonne Université, Institut du Cerveau, INSERM, Paris, France; EuroEPINOMICS RES Consortium
| | - Lorita La Selva
- Centre of Developmental Epilepsy and Electroencephalography, San Paolo Hospital, Bari, Italy
| | - Annalisa Vetro
- Pediatric Neurology, Neurogenetics and Neurobiology Unit and Laboratories, Meyer Children's Hospital, University of Florence, Florence, Italy
| | - Renzo Guerrini
- EuroEPINOMICS RES Consortium; Pediatric Neurology, Neurogenetics and Neurobiology Unit and Laboratories, Meyer Children's Hospital, University of Florence, Florence, Italy
| | - Caroline Nava
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Sorbonne Université, Institut du Cerveau, INSERM, Paris, France; EuroEPINOMICS RES Consortium
| | - Cyril Mignot
- AP-HP.Sorbonne Université, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France; Sorbonne Université, Institut du Cerveau, INSERM, Paris, France; EuroEPINOMICS RES Consortium.
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Gouronc A, Zilliox V, Jacquemont M, Darcel F, Leuvrey A, Nourisson E, Antin M, Alessandri J, Doray B, Gueguen P, Payet F, Randrianaivo H, Stoetzel C, Scheidecker S, Flodrops H, Dollfus H, Muller J. High prevalence of
Bardet‐Biedl
syndrome in
La Réunion
Island
is due to a founder variant in
ARL6/BBS3. Clin Genet 2020; 98:166-171. [DOI: 10.1111/cge.13768] [Citation(s) in RCA: 3] [Impact Index Per Article: 0.8] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/11/2020] [Revised: 04/24/2020] [Accepted: 04/27/2020] [Indexed: 12/11/2022]
Affiliation(s)
- Aurélie Gouronc
- Laboratoires de Diagnostic GénétiqueHôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
| | - Vincent Zilliox
- Unité Fonctionnelle de Bioinformatique Médicale appliquée au diagnostic (UF7363)Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
| | | | - Françoise Darcel
- Service des Maladies Neurologiques RaresGHSR, CHU de La Réunion Saint Pierre La Réunion France
| | - Anne‐Sophie Leuvrey
- Laboratoires de Diagnostic GénétiqueHôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
| | - Elsa Nourisson
- Laboratoires de Diagnostic GénétiqueHôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
| | - Manuela Antin
- Laboratoires de Diagnostic GénétiqueHôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
| | - Jean‐Luc Alessandri
- Pole Femme‐Mère‐Enfants, CH Félix GuyonCHU de La Réunion Saint‐Denis La Réunion France
| | - Bérénice Doray
- Service de Génétique, CH Félix GuyonCHU de La Réunion Saint‐Denis La Réunion France
| | - Paul Gueguen
- Service de Génétique, CH Félix GuyonCHU de La Réunion Saint‐Denis La Réunion France
| | - Frédérique Payet
- Service de Génétique, CH Félix GuyonCHU de La Réunion Saint‐Denis La Réunion France
| | | | - Corinne Stoetzel
- Laboratoire de Génétique MédicaleINSERM, UMRS_1112, Institut de Génétique Médicale d'Alsace (IGMA), Université de Strasbourg Faculté de médecine de Strasbourg Strasbourg France
| | - Sophie Scheidecker
- Laboratoires de Diagnostic GénétiqueHôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
- Laboratoire de Génétique MédicaleINSERM, UMRS_1112, Institut de Génétique Médicale d'Alsace (IGMA), Université de Strasbourg Faculté de médecine de Strasbourg Strasbourg France
| | - Hugues Flodrops
- Service de Pédiatrie, GHSRCHU de La Réunion Saint Pierre La Réunion France
| | - Hélène Dollfus
- Laboratoire de Génétique MédicaleINSERM, UMRS_1112, Institut de Génétique Médicale d'Alsace (IGMA), Université de Strasbourg Faculté de médecine de Strasbourg Strasbourg France
- Centre de Référence pour les affections rares en génétique ophtalmologique, CARGO, Filière SENSGENEHôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
- Service de Génétique MédicaleInstitut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
| | - Jean Muller
- Laboratoires de Diagnostic GénétiqueHôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
- Unité Fonctionnelle de Bioinformatique Médicale appliquée au diagnostic (UF7363)Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France
- Laboratoire de Génétique MédicaleINSERM, UMRS_1112, Institut de Génétique Médicale d'Alsace (IGMA), Université de Strasbourg Faculté de médecine de Strasbourg Strasbourg France
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