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Busby WH, Barve N, Cobos M, Peterson AT. EFFECTS OF LANDSCAPE HISTORY ON CURRENT GEOGRAPHIC DISTRIBUTIONS OF FOUR SPECIES OF REPTILES AND AMPHIBIANS IN KANSAS. SOUTHWEST NAT 2022. [DOI: 10.1894/0038-4909-66.2.157] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 11/20/2022]
Affiliation(s)
- William H. Busby
- Kansas Biological Survey, University of Kansas, Lawrence, KS 66047 (WHB)
| | - Narayani Barve
- Florida Museum of Natural History, University of Florida, Gainesville, FL 32611 (NB)
| | - Marlon Cobos
- Biodiversity Institute, University of Kansas, Lawrence, KS 66045 (NB, MC, ATP)
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Heritage S, Rayaleh H, Awaleh DG, Rathbun GB. New records of a lost species and a geographic range expansion for sengis in the Horn of Africa. PeerJ 2020; 8:e9652. [PMID: 32879790 PMCID: PMC7441985 DOI: 10.7717/peerj.9652] [Citation(s) in RCA: 5] [Impact Index Per Article: 1.3] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 04/29/2020] [Accepted: 07/13/2020] [Indexed: 11/27/2022] Open
Abstract
The Somali Sengi or Somali Elephant-shrew ('Elephantulus' revoilii, Macroscelidea, Mammalia) has been considered a "lost species" and is primarily known from about 39 museum specimens, with no new vouchered occurrence records since the early 1970s. The scientific literature contains no data concerning living Somali Sengi individuals and the species' current Data Deficient conservation status is attributable to an absence of modern information. Almost everything that has been published about the species is derived from anatomical examinations of historic specimens, gleaned from museum collection notes, or inferred from the known habits and ecology of other sengi taxa. Here we report new evidence that the Somali Sengi is currently extant. These data include voucher specimens, georeferenced occurrence localities, body measurements, habitat parameters, and DNA sequences. While the species is historically documented as endemic to Somalia, these new records are from the neighboring Republic of Djibouti and thus expand the Somali Sengi's known range in the Horn of Africa. Furthermore, Djiboutian locality data near international borders suggests that the Somali Sengi is also a current inhabitant of both Somalia and Ethiopia. Criteria that inform conservation status assessments (e.g., suitable habitat contiguity and occurrence in wildlife protected areas) can be positively characterized in Djibouti and therefore bode well for the survival of the Somali Sengi species. New data also inform previously undocumented substrate and sheltering affiliations. DNA analyses indicate that the Somali Sengi is a descendant of the Macroscelidini lineage and therefore reveal that the species' referral to the genus Elephantulus is incompatible with sengi phylogeny. This taxonomic issue is resolved by recognizing a new genus replacement and recombinant binomial that redesignates the Somali Sengi as Galegeeska revoilii (gen. nov., nov. comb). An analysis of ancestral biogeography suggests that the Somali Sengi has inhabited the Horn of Africa for more than 5.4 million years-and the recognition of the species' phylogenetic ancestry appends the already remarkable biogeographic story of the Macroscelidini tribe.
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Affiliation(s)
- Steven Heritage
- Division of Fossil Primates, Duke Lemur Center, Duke University, Durham, NC, USA
- Interdepartmental Doctoral Program in Anthropological Sciences, Stony Brook University, Stony Brook, NY, USA
| | - Houssein Rayaleh
- Association Djibouti Nature, Djibouti City, Republic of Djibouti
| | - Djama G. Awaleh
- Department of Environment and Sustainable Development, Ministry of Urban Affairs, Environment and Tourism, Djibouti City, Republic of Djibouti
| | - Galen B. Rathbun
- Institute of Biodiversity Science and Sustainability, California Academy of Sciences, San Francisco, CA, USA
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GonÇalves DV, Pereira P, Velo-AntÓn G, Harris DJ, Carranza S, Brito JC. Assessing the role of aridity-induced vicariance and ecological divergence in species diversification in North-West Africa using Agama lizards. Biol J Linn Soc Lond 2018. [DOI: 10.1093/biolinnean/bly055] [Citation(s) in RCA: 14] [Impact Index Per Article: 2.3] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 01/06/2023]
Affiliation(s)
- Duarte V GonÇalves
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, Vairão, Portugal
- Departamento de Biologia, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, Rua Campo Alegre, Porto, Portugal
- Institute of Evolutionary Biology (CSIC-Universitat Pompeu Fabra), Passeig Marítim de la Barceloneta, Barcelona, Spain
| | - Paulo Pereira
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, Vairão, Portugal
- Departamento de Biologia, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, Rua Campo Alegre, Porto, Portugal
| | - Guillermo Velo-AntÓn
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, Vairão, Portugal
| | - D James Harris
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, Vairão, Portugal
- Departamento de Biologia, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, Rua Campo Alegre, Porto, Portugal
| | - Salvador Carranza
- Institute of Evolutionary Biology (CSIC-Universitat Pompeu Fabra), Passeig Marítim de la Barceloneta, Barcelona, Spain
| | - JosÉ C Brito
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, Vairão, Portugal
- Departamento de Biologia, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, Rua Campo Alegre, Porto, Portugal
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Bonatelli IAS, Perez MF, Peterson AT, Taylor NP, Zappi DC, Machado MC, Koch I, Pires AHC, Moraes EM. Interglacial microrefugia and diversification of a cactus species complex: phylogeography and palaeodistributional reconstructions forPilosocereus aurisetusand allies. Mol Ecol 2014; 23:3044-63. [DOI: 10.1111/mec.12780] [Citation(s) in RCA: 83] [Impact Index Per Article: 8.3] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 05/18/2013] [Revised: 04/21/2014] [Accepted: 04/23/2014] [Indexed: 02/04/2023]
Affiliation(s)
- Isabel A. S. Bonatelli
- Departamento de Biologia; Universidade Federal de São Carlos; Rodovia João Leme dos Santos km 110 18052780 Sorocaba São Paulo Brazil
| | - Manolo F. Perez
- Departamento de Biologia; Universidade Federal de São Carlos; Rodovia João Leme dos Santos km 110 18052780 Sorocaba São Paulo Brazil
| | | | - Nigel P. Taylor
- National Parks Board; Singapore Botanic Gardens; 1 Cluny Road Singapore 259569 Singapore
- Royal Botanic Gardens; Kew Richmond Surrey TW9 3AB UK
| | - Daniela C. Zappi
- Royal Botanic Gardens; Kew Richmond Surrey TW9 3AB UK
- Gardens by the Bay; 18 Marina Gardens Drive Singapore Singapore
| | - Marlon C. Machado
- Departamento de Ciências Biológicas; Universidade Estadual de Feira de Santana; Rodovia BR 116 km 03 44031-460 Feira de Santana Bahia Brazil
| | - Ingrid Koch
- Departamento de Biologia; Universidade Federal de São Carlos; Rodovia João Leme dos Santos km 110 18052780 Sorocaba São Paulo Brazil
| | - Adriana H. C. Pires
- Departamento de Biologia; Universidade Federal de São Carlos; Rodovia João Leme dos Santos km 110 18052780 Sorocaba São Paulo Brazil
| | - Evandro M. Moraes
- Departamento de Biologia; Universidade Federal de São Carlos; Rodovia João Leme dos Santos km 110 18052780 Sorocaba São Paulo Brazil
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Lawson LP, Vernesi C, Ricci S, Rovero F. Evolutionary history of the grey-faced Sengi, Rhynchocyon udzungwensis, from Tanzania: a molecular and species distribution modelling approach. PLoS One 2013; 8:e72506. [PMID: 24015252 PMCID: PMC3754996 DOI: 10.1371/journal.pone.0072506] [Citation(s) in RCA: 7] [Impact Index Per Article: 0.6] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [MESH Headings] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/25/2013] [Accepted: 07/10/2013] [Indexed: 11/18/2022] Open
Abstract
Rhynchocyon udzungwensis is a recently described and poorly understood sengi (giant elephant-shrew) endemic to two small montane forests in Southern Tanzania, and surrounded in lower forests by R. cirnei reichardi. In this study, we investigate the molecular genetic relationship between R. udzungwensis and R. c. reichardi, and the possible role that shifting species distributions in response to climate fluctuations may have played in shaping their evolutionary history. Rhynchocyon udzungwensis and R. c. reichardi individuals were sampled from five localities for genetic analyses. Three mitochondrial and two nuclear loci were used to construct species trees for delimitation and to determine whether introgression was detectable either from ancient or ongoing hybridization. All species-tree results show R. udzungwensis and R. c. reichardi as distinct lineages, though mtDNA shows evidence of introgression in some populations. Nuclear loci of each species were monophyletic, implying introgression is exclusively historical. Because we found evidence of introgression, we used distribution data and species distribution modelling for present, glacial, and interglacial climate cycles to predict how shifting species distributions may have facilitated hybridization in some populations. Though interpretations are affected by the limited range of these species, a likely scenario is that the mtDNA introgression found in eastern mid-elevation populations was facilitated by low numbers of R. udzungwensis that expanded into lowland heavily occupied R. c. reichardi areas during interglacial climate cycles. These results imply that relationships within the genus Rhynchocyon may be confounded by porous species boundaries and introgression, even if species are not currently sympatric.
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Affiliation(s)
- Lucinda P. Lawson
- Department of Biological Sciences, University of Cincinnati, Cincinnati, Ohio, United States of America
| | - Cristiano Vernesi
- Department of Biodiversity and Molecular Ecology, Centre for Research and Innovation, Michele all’Adige, Italy
| | - Silvia Ricci
- Tropical Biodiversity Section, Museo delle Scienze, Trento, Italy
| | - Francesco Rovero
- Tropical Biodiversity Section, Museo delle Scienze, Trento, Italy
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Brito JC, Godinho R, Martínez-Freiría F, Pleguezuelos JM, Rebelo H, Santos X, Vale CG, Velo-Antón G, Boratyński Z, Carvalho SB, Ferreira S, Gonçalves DV, Silva TL, Tarroso P, Campos JC, Leite JV, Nogueira J, Álvares F, Sillero N, Sow AS, Fahd S, Crochet PA, Carranza S. Unravelling biodiversity, evolution and threats to conservation in the Sahara-Sahel. Biol Rev Camb Philos Soc 2013; 89:215-31. [DOI: 10.1111/brv.12049] [Citation(s) in RCA: 142] [Impact Index Per Article: 12.9] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 10/15/2012] [Revised: 05/28/2013] [Accepted: 06/19/2013] [Indexed: 11/28/2022]
Affiliation(s)
- José C. Brito
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Departamento de Biologia da; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - Raquel Godinho
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | - Fernando Martínez-Freiría
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | | | - Hugo Rebelo
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- School of Biological Sciences; University of Bristol; Bristol BS8 1UG U.K
| | - Xavier Santos
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | - Cândida G. Vale
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Departamento de Biologia da; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - Guillermo Velo-Antón
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | - Zbyszek Boratyński
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Centre of Excellence in Evolutionary Research, Department of Biological and Environmental Science; University of Jyväskylä; Survontie 9 Finland
| | - Sílvia B. Carvalho
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | - Sónia Ferreira
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Departamento de Biologia da; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - Duarte V. Gonçalves
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Departamento de Biologia da; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - Teresa L. Silva
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Departamento de Biologia da; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - Pedro Tarroso
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | - João C. Campos
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Departamento de Biologia da; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - João V. Leite
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | - Joana Nogueira
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
- Departamento de Biologia da; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - Francisco Álvares
- CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos da Universidade do Porto; Vairão 4485-661 Portugal
| | - Neftalí Sillero
- Centro de Investigação em Ciências Geo-Espaciais (CICGE) da Universidade do Porto; Porto 4169-007 Portugal
| | - Andack S. Sow
- Département de Biologie; Université Abdelmalek Essaâdi; Tétouan 93002 Morocco
| | - Soumia Fahd
- Département de Biologie; Université Abdelmalek Essaâdi; Tétouan 93002 Morocco
| | - Pierre-André Crochet
- EPHE-UMR 5175; Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive; Montpellier F-34293 France
| | - Salvador Carranza
- Institute of Evolutionary Biology; CSIC-Universitat Pompeu Fabra; Barcelona E-08003 Spain
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