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Oliveira BA, Oliveira LCD, Oliveira FMD, Pereira GM, Souza RMD, Manuli ER, Marchini FK, Espinoza EPS, Park M, Taniguchi L, Mendes PV, Franco LAM, Nastri AC, Oliveira MSD, Vieira Junior JM, Kallas EG, Levin AS, Sabino EC, Costa SF. Evaluation of eleven immunochromatographic assays for SARS-CoV-2 detection: investigating the dengue cross-reaction. Rev Inst Med Trop Sao Paulo 2022; 64:e63. [PMID: 36197424 PMCID: PMC9528753 DOI: 10.1590/s1678-9946202264063] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Track Full Text] [Download PDF] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 04/11/2022] [Accepted: 07/15/2022] [Indexed: 11/22/2022] Open
Abstract
COVID-19 disease is spread worldwide and diagnostic techniques have been studied in order to contain the pandemic. Immunochromatographic (IC) assays are feasible and a low-cost alternative especially in low and middle-income countries, which lack structure to perform certain diagnostic techniques. Here we evaluate the sensitivity and specificity of eleven different IC tests in 145 serum samples from confirmed cases of COVID-19 using RT-PCR and 100 negative serum samples from blood donors collected in February 2019. We also evaluated the cross-reactivity with dengue using 20 serum samples from patients with confirmed diagnosis for dengue collected in early 2019 through four different tests. We found high sensitivity (92%), specificity (100%) and an almost perfect agreement (Kappa 0.92) of IC assay, especially when we evaluated IgG and IgM combined after 10 days from the onset of symptoms with RT-PCR. However, we detected cross-reactivity between dengue and COVID-19 mainly with IgM antibodies (5 to 20% of cross-reaction) and demonstrated the need for better studies about diagnostic techniques for these diseases.
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Affiliation(s)
| | | | | | | | | | | | | | | | - Marcelo Park
- Universidade de São Paulo, Brazil; Hospital Sírio Libanês, Brazil
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Costa SF, Giavina-Bianchi P, Buss L, Mesquita Peres CH, Rafael MM, Dos Santos LGN, Bedin AA, Francisco MCPB, Satakie FM, Jesus Menezes MA, Dal Secco LM, Rodrigues Caron DM, de Oliveira AB, de Faria MFL, de Aurélio Penteado AS, de Souza IOM, de Fatima Pereira G, Pereira R, Matos Porto AP, Sanchez Espinoza EP, Mendes-Correa MC, Dos Santos Lazari C, Kalil J, de Moliterno Perondi MB, de Oliveira Bonfa ESD, Perreira AJ, Sabino E, da Silva Duarte AJ, Segurado AC, Dos Santos VA, Levin AS. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Seroprevalence and Risk Factors Among Oligo/Asymptomatic Healthcare Workers: Estimating the Impact of Community Transmission. Clin Infect Dis 2021; 73:e1214-e1218. [PMID: 33313659 PMCID: PMC7799298 DOI: 10.1093/cid/ciaa1845] [Citation(s) in RCA: 23] [Impact Index Per Article: 7.7] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 08/19/2020] [Indexed: 11/12/2022] Open
Abstract
We evaluated the seroprevalence of SARS-CoV-2 and risk factors among 4987 oligo/asymptomatic healthcare workers; seroprevalence was 14% and factors associated with SARS-CoV-2 infection were lower educational level (aOR, 1.93; 95% CI, 1.03-3.60), using public transport to work (aOR, 1.65; 95% CI, 1.07-2.62), and working in cleaning or security (aOR, 2.05; 95% CI, 1.04-4.03).
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Affiliation(s)
- Silvia Figueiredo Costa
- LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.,Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Pedro Giavina-Bianchi
- Clinical Immunology and Allergy Division, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Lewis Buss
- LIM-46, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | - Mayra Matias Rafael
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Lanuse Garcia Neves Dos Santos
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Anderson Aparecido Bedin
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | - Fatima Mitie Satakie
- Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | - Ligia Maria Dal Secco
- Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | - Allan Brum de Oliveira
- Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | | | | | - Grazielly de Fatima Pereira
- Clinical Immunology and Allergy Division, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Rafael Pereira
- Institute for Applied Economic Research, Brasilia, Brazil
| | - Ana Paula Matos Porto
- LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | - Maria Cassia Mendes-Correa
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.,LIM-46, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Carolina Dos Santos Lazari
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Jorge Kalil
- Clinical Immunology and Allergy Division, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | | | - Antonio Jose Perreira
- Covid-19 Emergency Committee, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Ester Sabino
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Alberto José da Silva Duarte
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Aluísio Cotrim Segurado
- LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.,Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.,Covid-19 Emergency Committee, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Vera Aparecida Dos Santos
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Anna S Levin
- LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.,Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
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Costa SF, Buss L, Espinoza EPS, Vieira JM, de Oliveira da Silva LC, de Souza RM, Neto LP, Porto APM, Lazari C, Dos Santos VA, da Silva Duarte A, Nastri AC, da Costa Leite GF, Manuli E, de Oliveira MS, Zampelli DB, Pastore L, Segurado AC, Levin AS, Sabino E. Performance of a qualitative rapid chromatographic immunoassay to diagnose COVID-19 in patients in a middle-income country. J Clin Virol 2020; 131:104592. [PMID: 32827898 PMCID: PMC7427616 DOI: 10.1016/j.jcv.2020.104592] [Citation(s) in RCA: 8] [Impact Index Per Article: 2.0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 06/30/2020] [Revised: 08/09/2020] [Accepted: 08/13/2020] [Indexed: 12/16/2022]
Abstract
COVID-19 diagnosis; high sensitivity and specificity qualitative rapid chromatographic immunoassays; can be used for the diagnosis of RT-PCR-negative patients.
Objectives We evaluated a rapid chromatographic immunoassay (IgG/IgM antibodies) and an ELISA assay to diagnose COVID-19 in patient sat two Brazilian hospitals. Methods A total of 122 subjects with COVID-19 were included: 106 SARS-COV-2 RT-PCR-positive patients and 16 RT-PCR-negative patients with symptoms and chest computed tomography (CT) consistent with COVID-19. Ninety-six historical blood donation samples were used as controls. Demographic and clinical characteristics were retrieved from electronic records. Sensitivity and specificity were calculated, as were their 95% binomial confidence intervals using the Clopper-Pearson method. All analyses were performed in R version 3.6.3. Results The sensitivity of the chromatographic immunoassay in all RT-PCR-positive patients, irrespective of the timing of symptom onset, was 85.8% (95% binomial CI 77.7% to 91.9%). This increased with time after symptom onset, and at >14 days was 94.9% (85.9% to 98.9%). The specificity was 100% (96.4% to 100%). 15/16 (94%) RT- PCR-negative cases tested positive. The most frequent comorbidities were hypertension and diabetes mellitus and the most frequent symptoms were fever, cough, and dyspnea. All RT-PCR-negative patients had pneumonia. The most frequent thoracic CT findings were ground glass changes (n = 11, 68%), which were bilateral in 9 (56%) patients, and diffuse reticulonodular infiltrates (n = 5, 31%). Conclusions The COVID-19 rapid chromatographic immunoassay evaluated in this study had a high sensitivity and specificity using plasma, particularly after 14 days from symptom onset. ELISA and qualitative rapid chromatographic immunoassays can be used for the diagnosis of RT-PCR-negative patients.
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Affiliation(s)
- Silvia Figueiredo Costa
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.
| | - Lewis Buss
- LIM-46, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Evelyn Patrícia Sanchez Espinoza
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | | | - Regina Maia de Souza
- LIM-46, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Lauro Perdigão Neto
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Ana Paula Matos Porto
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Carolina Lazari
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Brazil
| | - Vera Aparecida Dos Santos
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Brazil
| | - Alberto da Silva Duarte
- Divisão de Laboratório Central, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Brazil
| | - Ana Catharina Nastri
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | | | - Erika Manuli
- LIM-46, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Maura Salaroli de Oliveira
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; Hospital Sírio-Libanês, São Paulo, Brazil
| | | | | | - Aluísio Cotrim Segurado
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Anna S Levin
- Divisão de Moléstias Infecciosas, Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil; LIM-49, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
| | - Ester Sabino
- LIM-46, Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil
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