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Cuesta SA, Torres FJ, Rincón L, Paz JL, Márquez EA, Mora JR. Effect of the Nucleophile's Nature on Chloroacetanilide Herbicides Cleavage Reaction Mechanism. A DFT Study. Int J Mol Sci 2021; 22:ijms22136876. [PMID: 34206795 PMCID: PMC8268095 DOI: 10.3390/ijms22136876] [Citation(s) in RCA: 1] [Impact Index Per Article: 0.3] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 06/01/2021] [Revised: 06/21/2021] [Accepted: 06/23/2021] [Indexed: 11/16/2022] Open
Abstract
In this study, the degradation mechanism of chloroacetanilide herbicides in the presence of four different nucleophiles, namely: Br-, I-, HS-, and S2O3-2, was theoretically evaluated using the dispersion-corrected hybrid functional wB97XD and the DGDZVP as a basis set. The comparison of computed activation energies with experimental data shows an excellent correlation (R2 = 0.98 for alachlor and 0.97 for propachlor). The results suggest that the best nucleophiles are those where a sulfur atom performs the nucleophilic attack, whereas the other species are less reactive. Furthermore, it was observed that the different R groups of chloroacetanilide herbicides have a negligible effect on the activation energy of the process. Further insights into the mechanism show that geometrical changes and electronic rearrangements contribute 60% and 40% of the activation energy, respectively. A deeper analysis of the reaction coordinate was conducted, employing the evolution chemical potential, hardness, and electrophilicity index, as well as the electronic flux. The charge analysis shows that the electron density of chlorine increases as the nucleophilic attack occurs. Finally, NBO analysis indicates that the nucleophilic substitution in chloroacetanilides is an asynchronous process with a late transition state for all models except for the case of the iodide attack, which occurs through an early transition state in the reaction.
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Affiliation(s)
- Sebastián A. Cuesta
- Grupo de Química Computacional y Teórica (QCT-USFQ), Departamento de Ingeniería Química, Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador; (S.A.C.); (F.J.T.); (L.R.)
- Departamento de Ingeniería Química, Instituto de Simulación Computacional (ISC-USFQ), Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador
| | - F. Javier Torres
- Grupo de Química Computacional y Teórica (QCT-USFQ), Departamento de Ingeniería Química, Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador; (S.A.C.); (F.J.T.); (L.R.)
- Departamento de Ingeniería Química, Instituto de Simulación Computacional (ISC-USFQ), Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador
| | - Luis Rincón
- Grupo de Química Computacional y Teórica (QCT-USFQ), Departamento de Ingeniería Química, Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador; (S.A.C.); (F.J.T.); (L.R.)
- Departamento de Ingeniería Química, Instituto de Simulación Computacional (ISC-USFQ), Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador
| | - José Luis Paz
- Departamento Académico de Química Inorgánica, Facultad de Química e Ingeniería Química, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Cercado de Lima 15081, Peru;
| | - Edgar A. Márquez
- Grupo de Investigaciones en Química y Biología, Departamento de Química y Biología, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad del Norte, Carrera 51B, Km 5, Vía Puerto Colombia, Barranquilla 081007, Colombia
- Correspondence: (E.A.M.); (J.R.M.)
| | - José R. Mora
- Grupo de Química Computacional y Teórica (QCT-USFQ), Departamento de Ingeniería Química, Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador; (S.A.C.); (F.J.T.); (L.R.)
- Departamento de Ingeniería Química, Instituto de Simulación Computacional (ISC-USFQ), Universidad San Francisco de Quito, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito 170901, Ecuador
- Correspondence: (E.A.M.); (J.R.M.)
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