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Espitia Cogollo E, Echeverría GA, Piro OE, Jios JL, Ulic SE. Perhalomethyl Chromones: Spectroscopic, X‐Ray Diffraction, Hirshfeld Surface, and Density Functional Theory Studies of the Noncovalent Interactions. CRYSTAL RESEARCH AND TECHNOLOGY 2022. [DOI: 10.1002/crat.202200085] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 11/08/2022]
Affiliation(s)
- Edeimis Espitia Cogollo
- CEQUINOR (CONICET‐UNLP) Facultad de Ciencias Exactas Universidad Nacional de La Plata Bv. 120 N° 1465 La Plata 1900 Argentina
| | - Gustavo A. Echeverría
- Departamento de Física Facultad de Ciencias Exactas Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT‐La Plata) C. C. 67 La Plata 1900 Argentina
| | - Oscar E. Piro
- Departamento de Física Facultad de Ciencias Exactas Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT‐La Plata) C. C. 67 La Plata 1900 Argentina
| | - Jorge L. Jios
- Laboratorio UPL (UNLP‐CIC) Campus Tecnológico Gonnet (CIC‐BA) Cno. Centenario e/505 y 508 Gonnet (1897) Argentina
- Departamento de Química Facultad de Ciencias Exactas Universidad Nacional de La Plata 47 esq. 115 La Plata (1900) Argentina
| | - Sonia E. Ulic
- CEQUINOR (CONICET‐UNLP) Facultad de Ciencias Exactas Universidad Nacional de La Plata Bv. 120 N° 1465 La Plata 1900 Argentina
- Departamento de Ciencias Básicas Universidad Nacional de Luján Rutas 5 y 7 Luján Buenos Aires 6700 Argentina
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Narváez-Ordoñez EG, Pabón-Carcelén KA, Zurita-Saltos DA, Bonilla-Valladares PM, Yánez-Darquea TG, Ramos-Guerrero LA, Ulic SE, Jios JL, Echeverría GA, Piro OE, Langer P, Alcívar-León CD, Heredia-Moya J. Synthesis, Experimental and Theoretical Study of Azidochromones. MOLECULES (BASEL, SWITZERLAND) 2022; 27:molecules27092636. [PMID: 35565987 PMCID: PMC9105743 DOI: 10.3390/molecules27092636] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 01/31/2022] [Revised: 02/10/2022] [Accepted: 02/16/2022] [Indexed: 11/16/2022]
Abstract
A series of 2-(haloalkyl)-3-azidomethyl and 6-azido chromones has been synthetized, characterized and studied by theoretical (DFT calculations) and spectroscopic methods (UV-Vis, NMR). The crystal structure of 3-azidomethyl-2-difluoromethyl chromone, determined by X-ray diffraction methods, shows a planar framework due to extended π-bond delocalization. Its molecular packing is stabilized by F···H, N···H and O···H hydrogen bonds, π···π stacking and C–O···π intermolecular interactions. Moreover, AIM, NCI and Hirshfeld analysis evidenced that azido moiety has a significant role in the stabilization of crystal packing through weak intermolecular interactions, where analysis of electronic density suggested closed-shell (CS) interatomic interactions.
Collapse
Affiliation(s)
- Ena G. Narváez-Ordoñez
- Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Central del Ecuador, Francisco Viteri s/n y Gilberto Gato Sobral, Quito 170521, Ecuador; (E.G.N.-O.); (K.A.P.-C.); (D.A.Z.-S.); (P.M.B.-V.); (T.G.Y.-D.)
| | - Kevin A. Pabón-Carcelén
- Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Central del Ecuador, Francisco Viteri s/n y Gilberto Gato Sobral, Quito 170521, Ecuador; (E.G.N.-O.); (K.A.P.-C.); (D.A.Z.-S.); (P.M.B.-V.); (T.G.Y.-D.)
| | - Daniel A. Zurita-Saltos
- Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Central del Ecuador, Francisco Viteri s/n y Gilberto Gato Sobral, Quito 170521, Ecuador; (E.G.N.-O.); (K.A.P.-C.); (D.A.Z.-S.); (P.M.B.-V.); (T.G.Y.-D.)
| | - Pablo M. Bonilla-Valladares
- Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Central del Ecuador, Francisco Viteri s/n y Gilberto Gato Sobral, Quito 170521, Ecuador; (E.G.N.-O.); (K.A.P.-C.); (D.A.Z.-S.); (P.M.B.-V.); (T.G.Y.-D.)
| | - Trosky G. Yánez-Darquea
- Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Central del Ecuador, Francisco Viteri s/n y Gilberto Gato Sobral, Quito 170521, Ecuador; (E.G.N.-O.); (K.A.P.-C.); (D.A.Z.-S.); (P.M.B.-V.); (T.G.Y.-D.)
| | | | - Sonia E. Ulic
- CEQUINOR (CONICET-UNLP), Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Bv. 120 No 1465, La Plata 1900, Buenos Aires, Argentina;
- Departamento de Ciencias Básicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de Luján, Rutas 5 y 7, Luján 6700, Buenos Aires, Argentina
| | - Jorge L. Jios
- Laboratorio UPL (UNLP-CIC), Camino Centenario e/505 y 508 (1897) M.B. Gonnet and Departamento de Química, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, República Argentina. 47 esq. 115, La Plata 1900, Buenos Aires, Argentina;
| | - Gustavo A. Echeverría
- Departamento de Física, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT-La Plata), La Plata 1900, Buenos Aires, Argentina; (G.A.E.); (O.E.P.)
| | - Oscar E. Piro
- Departamento de Física, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT-La Plata), La Plata 1900, Buenos Aires, Argentina; (G.A.E.); (O.E.P.)
| | - Peter Langer
- Institut für Chemie, Universität Rostock, Albert-Einstein-Str. 3a, 18059 Rostock, Germany;
- Leibniz Institut für Katalyse, Universität Rostock e. V. (LIKAT), Albert-Einstein-Str. 29a, 18059 Rostock, Germany
| | - Christian D. Alcívar-León
- Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Central del Ecuador, Francisco Viteri s/n y Gilberto Gato Sobral, Quito 170521, Ecuador; (E.G.N.-O.); (K.A.P.-C.); (D.A.Z.-S.); (P.M.B.-V.); (T.G.Y.-D.)
- Correspondence: (C.D.A.-L.); (J.H.-M.)
| | - Jorge Heredia-Moya
- Centro de Investigación Biomédica (CENBIO), Facultad de Ciencias de la Salud Eugenio Espejo, Universidad UTE, Quito 170527, Ecuador
- Correspondence: (C.D.A.-L.); (J.H.-M.)
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Narváez O EG, Bonilla V. PM, Zurita DA, Alcívar L. CD, Heredia-Moya J, Ulic SE, Jios JL, Piro OE, Echeverría GA, Langer P. Synthesis, experimental and theoretical study of novel 2-haloalkyl (-CF2H, -CCl2H, -CF2CF3)-, 3-bromo and bromomethyl substituted chromones. J Fluor Chem 2021. [DOI: 10.1016/j.jfluchem.2020.109717] [Citation(s) in RCA: 1] [Impact Index Per Article: 0.3] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 01/17/2023]
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DeWeerd NJ, Bukovsky EV, Castro KP, Kuvychko IV, Popov AA, Strauss SH, Boltalina OV. Steric and electronic effects of CF3 conformations in acene(CF3) derivatives. J Fluor Chem 2019. [DOI: 10.1016/j.jfluchem.2019.02.010] [Citation(s) in RCA: 4] [Impact Index Per Article: 0.8] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 10/27/2022]
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Alcívar León CD, Echeverría GA, Piro OE, Ulic SE, Jios JL, Luna Tapia CA, Mera Guzmán MF. New thiourea and urea derivatives containing trifluoromethyl- and bis-triflouromethyl-4H-chromen-3-yl substituents. Mol Phys 2019. [DOI: 10.1080/00268976.2018.1514132] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 10/28/2022]
Affiliation(s)
- C. D. Alcívar León
- Centro de Investigación de Alimentos, CIAL, Facultad de Ciencias de la Ingeniería e Industrias, Universidad Tecnológica Equinoccial, Quito, Ecuador
| | - G. A. Echeverría
- Departamento de Física, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT-La Plata), La Plata, Argentina
| | - O. E. Piro
- Departamento de Física, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT-La Plata), La Plata, Argentina
| | - S. E. Ulic
- CEQUINOR (CONICET-UNLP), Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, La Plata, República Argentina
- Departamento de Ciencias Básicas, Universidad Nacional de Luján, Buenos Aires, República Argentina
| | - J. L. Jios
- UNIDAD PLAPIMU-LASEISIC (UNLP-CIC), Departamento de Química, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, La Plata, Argentina
| | - C. A. Luna Tapia
- Centro de Investigación de Alimentos, CIAL, Facultad de Ciencias de la Ingeniería e Industrias, Universidad Tecnológica Equinoccial, Quito, Ecuador
| | - M. F. Mera Guzmán
- Centro de Investigación de Alimentos, CIAL, Facultad de Ciencias de la Ingeniería e Industrias, Universidad Tecnológica Equinoccial, Quito, Ecuador
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Alcívar León CD, Echeverría GA, Piro OE, Ulic SE, Jios JL, Pereañez JA, Henao Castañeda IC, Pérez H. The role of non-covalent interactions in some 2-trifluoromethylchromones in the solid state. NEW J CHEM 2017. [DOI: 10.1039/c7nj00481h] [Citation(s) in RCA: 12] [Impact Index Per Article: 1.7] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 01/24/2023]
Abstract
Intermolecular interactions in chromone systems and criteria for the existence of C–H⋯F hydrogen bonds involving organic fluorine have been focused on in this work.
Collapse
Affiliation(s)
- Christian David Alcívar León
- Centro de Investigación de Alimentos
- CIAL
- Facultad de Ciencias de la Ingeniería e Industrias
- Universidad Tecnológica Equinoccial
- EC171029 Quito
| | - Gustavo Alberto Echeverría
- Departamento de Física
- Facultad de Ciencias Exactas
- Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT-La Plata)
- (1900) La Plata
- Republica Argentina
| | - Oscar Enrique Piro
- Departamento de Física
- Facultad de Ciencias Exactas
- Universidad Nacional de La Plata e IFLP (CONICET, CCT-La Plata)
- (1900) La Plata
- Republica Argentina
| | - Sonia Elizabeth Ulic
- CEQUINOR (CONICET-UNLP)
- Facultad de Ciencias Exactas
- Universidad Nacional de La Plata
- La Plata
- Republica Argentina
| | - Jorge Luis Jios
- UNIDAD PLAPIMU-LASEISIC (UNLP-CIC)
- Departamento de Química
- Facultad de Ciencias Exactas
- Universidad Nacional de La Plata
- (1897) Gonnet
| | - Jaime Andrés Pereañez
- Programa de Ofidismo/Escorpionimo
- Facultad de Ciencias Farmacéuticas y Alimentarias
- Universidad de Antioquia UdeA
- Medellín
- Colombia
| | - Isabel Cristina Henao Castañeda
- Grupo de Productos Naturales Marinos
- Facultad de Ciencias Farmacéuticas y Alimentarias
- Universidad de Antioquia UdeA
- Medellín
- Colombia
| | - Hiram Pérez
- Departamento de Química Inorgánica
- Facultad de Química
- Universidad de La Habana
- La Habana 10400
- Cuba
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Alcívar León C, Echeverría G, Piro O, Ulic S, Jios J, Burgos Paci M, Argüello G. The role of halogen C–X1⋯X2–C contact on the preferred conformation of 2-perhalomethylchromones in solid state. Chem Phys 2016. [DOI: 10.1016/j.chemphys.2016.03.017] [Citation(s) in RCA: 7] [Impact Index Per Article: 0.9] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 01/11/2023]
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