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Lourenço Neto M, Agra KL, Suassuna Filho J, Jorge FE. TDDFT calculations and photoacoustic spectroscopy experiments used to identify phenolic acid functional biomolecules in Brazilian tropical fruits in natura. SPECTROCHIMICA ACTA. PART A, MOLECULAR AND BIOMOLECULAR SPECTROSCOPY 2018; 193:249-257. [PMID: 29258020 DOI: 10.1016/j.saa.2017.12.036] [Citation(s) in RCA: 5] [Impact Index Per Article: 0.8] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 07/20/2017] [Revised: 11/27/2017] [Accepted: 12/08/2017] [Indexed: 06/07/2023]
Abstract
Time-dependent density functional theory (TDDFT) calculations of electronic transitions have been widely used to determine molecular structures. The excitation wavelengths and oscillator strengths obtained with the hybrid exchange-correlation functional B3LYP in conjunction with the ADZP basis set are employed to simulate the UV-Vis spectra of eight phenolic acids. Experimental and theoretical UV-Vis spectra reported previously in the literature are compared with our results. The fast, sensitive and non-destructive technique of photoacoustic spectroscopy (PAS) is used to determine the UV-Vis spectra of four Brazilian tropical fresh fruits in natura. Then, the PAS along with the TDDFT results are for the first time used to investigate and identify the presence of phenolic acids in the fruits studied in this work. This theoretical method with this experimental technique show to be a powerful and cheap tool to detect the existence of phenolic acids in fruits, vegetables, cereals, and grains. Comparison with high performance liquid chromatography results, when available, is also carried out.
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Affiliation(s)
- M Lourenço Neto
- Departamento de Ciências Básicas e Sociais, Universidade Federal da Paraíba, Campus III, 58220-000 Bananeiras, Brazil
| | - K L Agra
- Unidade Acadêmica de Física, Universidade Federal de Campina Grande, 58429-900 Campina Grande, Brazil
| | - J Suassuna Filho
- Unidade Acadêmica de Física, Universidade Federal de Campina Grande, 58429-900 Campina Grande, Brazil
| | - F E Jorge
- Unidade Acadêmica de Física, Universidade Federal de Campina Grande, 58429-900 Campina Grande, Brazil; Departamento de Física, Universidade Federal do Espírito Santo, 29060-900 Vitória, Brazil.
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Carrillo-Parramon O, Del Galdo S, Aschi M, Mancini G, Amadei A, Barone V. Flexible and Comprehensive Implementation of MD-PMM Approach in a General and Robust Code. J Chem Theory Comput 2017; 13:5506-5514. [DOI: 10.1021/acs.jctc.7b00341] [Citation(s) in RCA: 14] [Impact Index Per Article: 2.0] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 02/01/2023]
Affiliation(s)
| | - Sara Del Galdo
- Scuola Normale Superiore di Pisa, Piazza dei Cavalieri 7 I-56126, Pisa, Italy
| | - Massimiliano Aschi
- Dipartimento
di Scienze Fisiche e Chimiche, Universitá di L’Aquila, Via
Vetoio s.n.c.67100, L’Aquila, Italy
| | - Giordano Mancini
- Scuola Normale Superiore di Pisa, Piazza dei Cavalieri 7 I-56126, Pisa, Italy
- Istituto Nazionale di Fisica Nucleare (INFN) sezione di Pisa, Largo Bruno Pontecorvo 3, 56127 Pisa, Italy
| | - Andrea Amadei
- Dipartimento
di Scienze e Tecnologie Chimiche, Universitá di Roma ’Tor Vergata’, Via Della Ricerca Scientifica, 00100 Roma, Italy
| | - Vincenzo Barone
- Scuola Normale Superiore di Pisa, Piazza dei Cavalieri 7 I-56126, Pisa, Italy
- Istituto Nazionale di Fisica Nucleare (INFN) sezione di Pisa, Largo Bruno Pontecorvo 3, 56127 Pisa, Italy
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Zazza C, Olsen JM, Kongsted J. Solvatochromic shifts vs nanosolvation patterns: Uracil in water as a test case. COMPUT THEOR CHEM 2011. [DOI: 10.1016/j.comptc.2011.07.020] [Citation(s) in RCA: 4] [Impact Index Per Article: 0.3] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 12/11/2022]
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Zazza C, Coletta A, Sanna N, Chillemi G, Mancini G, Desideri A. Solvent Effects on the Valence UV−Vis Absorption Spectra of Topotecan Anticancer Drug in Aqueous Solution at Room Temperature: A Nanoseconds Time-Scale TD-DFT/MD Computational Study. J Phys Chem B 2010; 114:6770-8. [PMID: 20438088 DOI: 10.1021/jp1015824] [Citation(s) in RCA: 12] [Impact Index Per Article: 0.9] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 01/28/2023]
Affiliation(s)
- Costantino Zazza
- CASPUR, Consorzio Interuniversitario per le Applicazioni di Supercalcolo per Università e Ricerca, Via dei Tizii, 6/b, 00185 Roma, Italy, and Dipartimento di Biologia, Università di Roma “Tor Vergata”, via della Ricerca Scientifica, 00133 Roma, Italy
| | - Andrea Coletta
- CASPUR, Consorzio Interuniversitario per le Applicazioni di Supercalcolo per Università e Ricerca, Via dei Tizii, 6/b, 00185 Roma, Italy, and Dipartimento di Biologia, Università di Roma “Tor Vergata”, via della Ricerca Scientifica, 00133 Roma, Italy
| | - Nico Sanna
- CASPUR, Consorzio Interuniversitario per le Applicazioni di Supercalcolo per Università e Ricerca, Via dei Tizii, 6/b, 00185 Roma, Italy, and Dipartimento di Biologia, Università di Roma “Tor Vergata”, via della Ricerca Scientifica, 00133 Roma, Italy
| | - Giovanni Chillemi
- CASPUR, Consorzio Interuniversitario per le Applicazioni di Supercalcolo per Università e Ricerca, Via dei Tizii, 6/b, 00185 Roma, Italy, and Dipartimento di Biologia, Università di Roma “Tor Vergata”, via della Ricerca Scientifica, 00133 Roma, Italy
| | - Giordano Mancini
- CASPUR, Consorzio Interuniversitario per le Applicazioni di Supercalcolo per Università e Ricerca, Via dei Tizii, 6/b, 00185 Roma, Italy, and Dipartimento di Biologia, Università di Roma “Tor Vergata”, via della Ricerca Scientifica, 00133 Roma, Italy
| | - Alessandro Desideri
- CASPUR, Consorzio Interuniversitario per le Applicazioni di Supercalcolo per Università e Ricerca, Via dei Tizii, 6/b, 00185 Roma, Italy, and Dipartimento di Biologia, Università di Roma “Tor Vergata”, via della Ricerca Scientifica, 00133 Roma, Italy
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