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Smol T, Petit F, Piton A, Keren B, Sanlaville D, Afenjar A, Baker S, Bedoukian EC, Bhoj EJ, Bonneau D, Boudry-Labis E, Bouquillon S, Boute-Benejean O, Caumes R, Chatron N, Colson C, Coubes C, Coutton C, Devillard F, Dieux-Coeslier A, Doco-Fenzy M, Ewans LJ, Faivre L, Fassi E, Field M, Fournier C, Francannet C, Genevieve D, Giurgea I, Goldenberg A, Green AK, Guerrot AM, Heron D, Isidor B, Keena BA, Krock BL, Kuentz P, Lapi E, Le Meur N, Lesca G, Li D, Marey I, Mignot C, Nava C, Nesbitt A, Nicolas G, Roche-Lestienne C, Roscioli T, Satre V, Santani A, Stefanova M, Steinwall Larsen S, Saugier-Veber P, Picker-Minh S, Thuillier C, Verloes A, Vieville G, Wenzel M, Willems M, Whalen S, Zarate YA, Ziegler A, Manouvrier-Hanu S, Kalscheuer VM, Gerard B, Ghoumid J. MED13L-related intellectual disability: involvement of missense variants and delineation of the phenotype. Neurogenetics 2018; 19:93-103. [PMID: 29511999 DOI: 10.1007/s10048-018-0541-0] [Citation(s) in RCA: 19] [Impact Index Per Article: 3.2] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 11/28/2017] [Accepted: 02/17/2018] [Indexed: 12/30/2022]
Abstract
Molecular anomalies in MED13L, leading to haploinsufficiency, have been reported in patients with moderate to severe intellectual disability (ID) and distinct facial features, with or without congenital heart defects. Phenotype of the patients was referred to "MED13L haploinsufficiency syndrome." Missense variants in MED13L were already previously described to cause the MED13L-related syndrome, but only in a limited number of patients. Here we report 36 patients with MED13L molecular anomaly, recruited through an international collaboration between centers of expertise for developmental anomalies. All patients presented with intellectual disability and severe language impairment. Hypotonia, ataxia, and recognizable facial gestalt were frequent findings, but not congenital heart defects. We identified seven de novo missense variations, in addition to protein-truncating variants and intragenic deletions. Missense variants clustered in two mutation hot-spots, i.e., exons 15-17 and 25-31. We found that patients carrying missense mutations had more frequently epilepsy and showed a more severe phenotype. This study ascertains missense variations in MED13L as a cause for MED13L-related intellectual disability and improves the clinical delineation of the condition.
Collapse
Affiliation(s)
- T Smol
- Institut de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, Lille, France.,University of Lille, EA 7364-RADEME, Lille, France
| | - F Petit
- University of Lille, EA 7364-RADEME, Lille, France.,Service de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, avenue Eugène Avinée, Lille, France
| | - A Piton
- Laboratoire de diagnostic génétique, Institut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - B Keren
- Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris, France
| | - D Sanlaville
- Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France
| | - A Afenjar
- Service de Génétique, Hôpital d'Enfants Armand-Trousseau, AP-HP, Paris, France
| | - S Baker
- Department of Pathology Laboratory Medicine, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - E C Bedoukian
- Roberts Individualized Medical Genetics Center, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - E J Bhoj
- Department of Pathology Laboratory Medicine, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - D Bonneau
- Service de Génétique, CHU d'Angers, Angers, France
| | - E Boudry-Labis
- Institut de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, Lille, France
| | - S Bouquillon
- Institut de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, Lille, France
| | - O Boute-Benejean
- University of Lille, EA 7364-RADEME, Lille, France.,Service de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, avenue Eugène Avinée, Lille, France
| | - R Caumes
- Service de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, avenue Eugène Avinée, Lille, France
| | - N Chatron
- Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France
| | - C Colson
- University of Lille, EA 7364-RADEME, Lille, France.,Service de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, avenue Eugène Avinée, Lille, France
| | - C Coubes
- Département de Génétique Médicale, CHU Montpellier, Montpellier, France
| | - C Coutton
- Laboratoire de Génétique Chromosomique, CHU Grenoble Alpes, Grenoble, France
| | - F Devillard
- Laboratoire de Génétique Chromosomique, CHU Grenoble Alpes, Grenoble, France
| | - A Dieux-Coeslier
- University of Lille, EA 7364-RADEME, Lille, France.,Service de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, avenue Eugène Avinée, Lille, France
| | - M Doco-Fenzy
- Service de Génétique, EA3801, SFR-CAP Santé, CHU de Reims, Reims, France
| | - L J Ewans
- St Vincent's Clinical School, University of New South Wales, Darlinghurst, New South Wales, Australia
| | - L Faivre
- Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares 'Anomalies du Développement, CHU Dijon, Dijon, France.,Equipe GAD, UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France
| | - E Fassi
- Division of Genetics and Genomic Medicine, Department of Pediatrics, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA
| | - M Field
- The Genetics of Learning Disability Service, Waratah, New South Wales, Australia
| | - C Fournier
- Laboratoire de diagnostic génétique, Institut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - C Francannet
- Service de Génétique Médicale, CHU de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand, France
| | - D Genevieve
- Département de Génétique Médicale, CHU Montpellier, Montpellier, France
| | - I Giurgea
- Service de Génétique, Hôpital Trousseau, AP-HP, Paris, France
| | - A Goldenberg
- Service de Génétique et Inserm U1079, Centre Normand de Génomique Médicale et Médecine Personnalisée, CHU de Rouen, Inserm et Université de Rouen, Rouen, France
| | - A K Green
- Department of Clinical Genetics, University Hospital Linköping, Linköping, Sweden
| | - A M Guerrot
- Service de Génétique et Inserm U1079, Centre Normand de Génomique Médicale et Médecine Personnalisée, CHU de Rouen, Inserm et Université de Rouen, Rouen, France
| | - D Heron
- Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris, France
| | - B Isidor
- Service de Génétique Médicale, Unité de Génétique Clinique, CHU de Nantes, Nantes, France
| | - B A Keena
- Clinical Genetics, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - B L Krock
- Department of Pathology Laboratory Medicine, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - P Kuentz
- Equipe GAD, UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France
| | - E Lapi
- Medical Genetics Unit, Anna Meyer Children's University Hospital, Florence, Italy
| | - N Le Meur
- Service de Génétique et Inserm U1079, Centre Normand de Génomique Médicale et Médecine Personnalisée, CHU de Rouen, Inserm et Université de Rouen, Rouen, France
| | - G Lesca
- Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France
| | - D Li
- Department of Pathology Laboratory Medicine, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - I Marey
- Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris, France
| | - C Mignot
- Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris, France
| | - C Nava
- Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris, France
| | - A Nesbitt
- Department of Pathology Laboratory Medicine, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - G Nicolas
- Service de Génétique et Inserm U1079, Centre Normand de Génomique Médicale et Médecine Personnalisée, CHU de Rouen, Inserm et Université de Rouen, Rouen, France
| | - C Roche-Lestienne
- Institut de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, Lille, France
| | - T Roscioli
- St Vincent's Clinical School, University of New South Wales, Darlinghurst, New South Wales, Australia
| | - V Satre
- Laboratoire de Génétique Chromosomique, CHU Grenoble Alpes, Grenoble, France
| | - A Santani
- Department of Pathology Laboratory Medicine, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - M Stefanova
- Department of Clinical Genetics, University Hospital Linköping, Linköping, Sweden
| | - S Steinwall Larsen
- Department of Clinical Genetics, University Hospital Linköping, Linköping, Sweden
| | - P Saugier-Veber
- Service de Génétique et Inserm U1079, Centre Normand de Génomique Médicale et Médecine Personnalisée, CHU de Rouen, Inserm et Université de Rouen, Rouen, France
| | - S Picker-Minh
- Department of Pediatric Neurology, Charité-Universitätsmedizin Berlin, Berlin, Germany
| | - C Thuillier
- Institut de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, Lille, France
| | - A Verloes
- Unité Fonctionnelle de Génétique Clinique, Hôpital Robert Debré, AP-HP, Paris, France
| | - G Vieville
- Laboratoire de Génétique Chromosomique, CHU Grenoble Alpes, Grenoble, France
| | - M Wenzel
- Clinical Genetics, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
| | - M Willems
- Département de Génétique Médicale, CHU Montpellier, Montpellier, France
| | - S Whalen
- Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris, France
| | - Y A Zarate
- Section of Genetics and Metabolism, Department of Pediatrics, University of Arkansas for Medical Sciences, Little Rock, AR, USA
| | - A Ziegler
- Service de Génétique, CHU d'Angers, Angers, France
| | - S Manouvrier-Hanu
- University of Lille, EA 7364-RADEME, Lille, France.,Service de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, avenue Eugène Avinée, Lille, France
| | - V M Kalscheuer
- Research Group Development and Disease, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany
| | - B Gerard
- Laboratoire de diagnostic génétique, Institut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - Jamal Ghoumid
- University of Lille, EA 7364-RADEME, Lille, France. .,Service de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre, CHU Lille, avenue Eugène Avinée, Lille, France.
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3
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Mehawej C, Hoischen A, Farah RA, Marey I, David M, Stora S, Lachlan K, Brunner HG, Mégarbané A. Homozygous mutation in ELMO2 may cause Ramon syndrome. Clin Genet 2018; 93:703-706. [PMID: 29095483 DOI: 10.1111/cge.13166] [Citation(s) in RCA: 8] [Impact Index Per Article: 1.3] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 07/28/2017] [Revised: 10/24/2017] [Accepted: 10/30/2017] [Indexed: 11/30/2022]
Abstract
We report on a girl, born to first cousin Lebanese parents, with intellectual disability, seizures, repeated gingivorrhagia, enlarged lower and upper jaws, overgrowth of the gums, high arched and narrow palate, crowded teeth, hirsutism of the back, large abdomen and a small umbilical hernia. Cysts of the mandible, fibrous dysplasia of bones, and enlarged adenoids causing around 60% narrowing of the nasopharyngeal airways were noted at radiographic examination. Her brother presented with the same features in addition to a short stature, an ostium secundum, and more pronounced intellectual disability. He died at the age of 8 years from a severe pulmonary infection and repeated bleeding episodes. A clinical diagnosis of Ramon syndrome was made. Whole exome sequencing studies performed on the family revealed the presence of a novel homozygous missense mutation in ELMO2 gene, p.I606S in the affected individuals. Loss of function mutations in ELMO2 have been recently described in another clinically distinct condition: primary intraosseous vascular malformation or intraosseous hemangioma, called VMOS. Review of the literature and differential diagnoses are discussed.
Collapse
Affiliation(s)
- C Mehawej
- Unité de GénétiqueMédicale, Faculté de Médecine, Université Saint-Joseph, Beirut, Lebanon
| | - A Hoischen
- Department of Human Genetics, Radboud University Medical Center, Nijmegen, the Netherlands.,Department of Internal Medicine and Radboud Center for Infectious Diseases (RCI), Radboud University Medical Center, Nijmegen, the Netherlands.,Radboud Institute for Molecular Life Sciences, Nijmegen, the Netherlands
| | - R A Farah
- Division of Hematology/Oncology, Department of Pediatrics, Saint George Hospital University Medical Center, Beirut, Lebanon
| | - I Marey
- Institut Jérôme Lejeune, Paris, France
| | - M David
- Institut Jérôme Lejeune, Paris, France
| | - S Stora
- Institut Jérôme Lejeune, Paris, France
| | - K Lachlan
- Human Genetics & Genomic Medicine, Southampton General Hospital, University of Southampton, Southampton, UK.,Wessex Clinical Genetics Service, Princess Anne Hospital, University Hospital Southampton NHS Foundation Trust, Southampton, UK
| | - H G Brunner
- Department of Human Genetics, Radboud University Medical Center, Nijmegen, the Netherlands.,Department of Clinical Genetics and GROW School for Oncology and Developmental Biology, Maastricht UMC, Maastricht, the Netherlands
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Collapse
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Chérot E, Keren B, Dubourg C, Carré W, Fradin M, Lavillaureix A, Afenjar A, Burglen L, Whalen S, Charles P, Marey I, Heide S, Jacquette A, Heron D, Doummar D, Rodriguez D, Billette de Villemeur T, Moutard ML, Guët A, Xavier J, Périsse D, Cohen D, Demurger F, Quélin C, Depienne C, Odent S, Nava C, David V, Pasquier L, Mignot C. Using medical exome sequencing to identify the causes of neurodevelopmental disorders: Experience of 2 clinical units and 216 patients. Clin Genet 2017; 93:567-576. [DOI: 10.1111/cge.13102] [Citation(s) in RCA: 58] [Impact Index Per Article: 8.3] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 02/10/2017] [Revised: 07/07/2017] [Accepted: 07/10/2017] [Indexed: 12/19/2022]
Affiliation(s)
- E. Chérot
- Service de Génétique Médicale; CLAD Ouest CHU Hôpital Sud; Rennes France
- Laboratoire de Génétique moléculaire et Génomique; CHU Pontchaillou; Rennes France
| | - B. Keren
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme"; UPMC; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "ConCer-LD"; UPMC; Paris France
| | - C. Dubourg
- Laboratoire de Génétique moléculaire et Génomique; CHU Pontchaillou; Rennes France
- CNRS UMR 6290 (IGDR); Université de Rennes 1; Rennes France
| | - W. Carré
- Laboratoire de Génétique moléculaire et Génomique; CHU Pontchaillou; Rennes France
| | - M. Fradin
- Service de Génétique Médicale; CLAD Ouest CHU Hôpital Sud; Rennes France
| | - A. Lavillaureix
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
| | - A. Afenjar
- Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- APHP, GHUEP, Hôpital Armand Trousseau; Centre de Référence 'Malformations et maladies congénitales du cervelet'; Paris France
- Département de Génétique, APHP, GHUEP; Hôpital Armand-Trousseau; Paris France
| | - L. Burglen
- APHP, GHUEP, Hôpital Armand Trousseau; Centre de Référence 'Malformations et maladies congénitales du cervelet'; Paris France
- Département de Génétique, APHP, GHUEP; Hôpital Armand-Trousseau; Paris France
| | - S. Whalen
- APHP, GHUEP, Hôpital Armand Trousseau; Centre de Référence 'Malformations et maladies congénitales du cervelet'; Paris France
- Département de Génétique, APHP, GHUEP; Hôpital Armand-Trousseau; Paris France
| | - P. Charles
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme"; UPMC; Paris France
- Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
| | - I. Marey
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme"; UPMC; Paris France
- Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
| | - S. Heide
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme"; UPMC; Paris France
- Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
| | - A. Jacquette
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme"; UPMC; Paris France
- Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
| | - D. Heron
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme"; UPMC; Paris France
- Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
| | - D. Doummar
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "ConCer-LD"; UPMC; Paris France
- AP-HP, Service de Neuropédiatrie; Hôpital Armand Trousseau; Paris France
- AP-HP, Hôpital Armand Trousseau; Centre de Référence Neurogénétique de l'Enfant à l'adulte; Paris France
| | - D. Rodriguez
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "ConCer-LD"; UPMC; Paris France
- AP-HP, Service de Neuropédiatrie; Hôpital Armand Trousseau; Paris France
- AP-HP, Hôpital Armand Trousseau; Centre de Référence Neurogénétique de l'Enfant à l'adulte; Paris France
| | - T. Billette de Villemeur
- AP-HP, Service de Neuropédiatrie; Hôpital Armand Trousseau; Paris France
- AP-HP, Service de Pédiatrie; Hôpital Louis Mourier; Colombes France
| | - M.-L. Moutard
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "ConCer-LD"; UPMC; Paris France
- AP-HP, Service de Neuropédiatrie; Hôpital Armand Trousseau; Paris France
| | - A. Guët
- AP-HP, Service de Pédiatrie; Hôpital Louis Mourier; Colombes France
| | - J. Xavier
- AP-HP, Department of Child and Adolescent Psychiatry; Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière et University Pierre and Marie Curie; Paris France
- Sorbonne Universités, UPMC, CNRS UMR 7222; Institut des Systèmes Intelligents et Robotiques; Paris France
| | - D. Périsse
- AP-HP, Department of Child and Adolescent Psychiatry; Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière et University Pierre and Marie Curie; Paris France
| | - D. Cohen
- AP-HP, Department of Child and Adolescent Psychiatry; Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière et University Pierre and Marie Curie; Paris France
- Sorbonne Universités, UPMC, CNRS UMR 7222; Institut des Systèmes Intelligents et Robotiques; Paris France
| | - F. Demurger
- Service de Génétique Médicale; CLAD Ouest CHU Hôpital Sud; Rennes France
| | - C. Quélin
- Service de Génétique Médicale; CLAD Ouest CHU Hôpital Sud; Rennes France
| | - C. Depienne
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- INSERM U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127; Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, ICM; Paris France
| | - S. Odent
- Service de Génétique Médicale; CLAD Ouest CHU Hôpital Sud; Rennes France
- CNRS UMR 6290 (IGDR); Université de Rennes 1; Rennes France
| | - C. Nava
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- INSERM U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127; Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, ICM; Paris France
| | - V. David
- Laboratoire de Génétique moléculaire et Génomique; CHU Pontchaillou; Rennes France
- CNRS UMR 6290 (IGDR); Université de Rennes 1; Rennes France
| | - L. Pasquier
- Service de Génétique Médicale; CLAD Ouest CHU Hôpital Sud; Rennes France
- INSERM CIC pédiatrique 1414; CHU Pontchaillou; Rennes France
| | - C. Mignot
- Département de Génétique, AP-HP; Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme"; UPMC; Paris France
- Groupe de Recherche Clinique (GRC) "ConCer-LD"; UPMC; Paris France
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