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Vishnopolska SA, Mercogliano MF, Camilletti MA, Mortensen AH, Braslavsky D, Keselman A, Bergadá I, Olivieri F, Miranda L, Marino R, Ramírez P, Pérez Garrido N, Patiño Mejia H, Ciaccio M, Di Palma MI, Belgorosky A, Martí MA, Kitzman JO, Camper SA, Pérez-Millán MI. Comprehensive Identification of Pathogenic Gene Variants in Patients With Neuroendocrine Disorders. J Clin Endocrinol Metab 2021; 106:1956-1976. [PMID: 33729509 PMCID: PMC8208670 DOI: 10.1210/clinem/dgab177] [Citation(s) in RCA: 9] [Impact Index Per Article: 3.0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Grants] [Track Full Text] [Journal Information] [Submit a Manuscript] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 10/02/2020] [Revised: 02/12/2021] [Indexed: 02/03/2023]
Abstract
PURPOSE Congenital hypopituitarism (CH) can present in isolation or with other birth defects. Mutations in multiple genes can cause CH, and the use of a genetic screening panel could establish the prevalence of mutations in known and candidate genes for this disorder. It could also increase the proportion of patients that receive a genetic diagnosis. METHODS We conducted target panel genetic screening using single-molecule molecular inversion probes sequencing to assess the frequency of mutations in known hypopituitarism genes and new candidates in Argentina. We captured genomic deoxyribonucleic acid from 170 pediatric patients with CH, either alone or with other abnormalities. We performed promoter activation assays to test the functional effects of patient variants in LHX3 and LHX4. RESULTS We found variants classified as pathogenic, likely pathogenic, or with uncertain significance in 15.3% of cases. These variants were identified in known CH causative genes (LHX3, LHX4, GLI2, OTX2, HESX1), in less frequently reported genes (FOXA2, BMP4, FGFR1, PROKR2, PNPLA6) and in new candidate genes (BMP2, HMGA2, HNF1A, NKX2-1). CONCLUSION In this work, we report the prevalence of mutations in known CH genes in Argentina and provide evidence for new candidate genes. We show that CH is a genetically heterogeneous disease with high phenotypic variation and incomplete penetrance, and our results support the need for further gene discovery for CH. Identifying population-specific pathogenic variants will improve the capacity of genetic data to predict eventual clinical outcomes.
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Affiliation(s)
- Sebastian Alexis Vishnopolska
- Instituto de Biociencias, Biotecnología y Biología Traslacional (IB3), Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
- Instituto de Química Biología en Exactas y Naturales (IQUIBICEN-CONICET), Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
| | - Maria Florencia Mercogliano
- Instituto de Química Biología en Exactas y Naturales (IQUIBICEN-CONICET), Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
| | - Maria Andrea Camilletti
- Instituto de Biociencias, Biotecnología y Biología Traslacional (IB3), Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
- Instituto de Química Biología en Exactas y Naturales (IQUIBICEN-CONICET), Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
| | - Amanda Helen Mortensen
- Deptartment of Human Genetics, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI 48198-5618, USA
| | - Debora Braslavsky
- Centro de Investigaciones Endocrinológicas “Dr. César Bergadá,” (CEDIE), FEI – CONICET – División de Endocrinología, Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, Ciudad de Buenos Aires, C1425EFD, Argentina
| | - Ana Keselman
- Centro de Investigaciones Endocrinológicas “Dr. César Bergadá,” (CEDIE), FEI – CONICET – División de Endocrinología, Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, Ciudad de Buenos Aires, C1425EFD, Argentina
| | - Ignacio Bergadá
- Centro de Investigaciones Endocrinológicas “Dr. César Bergadá,” (CEDIE), FEI – CONICET – División de Endocrinología, Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, Ciudad de Buenos Aires, C1425EFD, Argentina
| | - Federico Olivieri
- Instituto de Química Biología en Exactas y Naturales (IQUIBICEN-CONICET), Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
| | - Lucas Miranda
- Instituto de Química Biología en Exactas y Naturales (IQUIBICEN-CONICET), Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
| | - Roxana Marino
- Servicio de Endocrinología, Hospital Garrahan, Ciudad de Buenos Aires, C1245, Argentina
| | - Pablo Ramírez
- Servicio de Endocrinología, Hospital Garrahan, Ciudad de Buenos Aires, C1245, Argentina
| | - Natalia Pérez Garrido
- Servicio de Endocrinología, Hospital Garrahan, Ciudad de Buenos Aires, C1245, Argentina
| | - Helen Patiño Mejia
- Servicio de Endocrinología, Hospital Garrahan, Ciudad de Buenos Aires, C1245, Argentina
| | - Marta Ciaccio
- Servicio de Endocrinología, Hospital Garrahan, Ciudad de Buenos Aires, C1245, Argentina
| | - Maria Isabel Di Palma
- Servicio de Endocrinología, Hospital Garrahan, Ciudad de Buenos Aires, C1245, Argentina
| | - Alicia Belgorosky
- Hospital de Pediatría Garrahan-CONICET, Ciudad de Buenos Aires, Argentina
| | - Marcelo Adrian Martí
- Instituto de Química Biología en Exactas y Naturales (IQUIBICEN-CONICET), Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
| | - Jacob Otto Kitzman
- Deptartment of Human Genetics, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI 48198-5618, USA
| | - Sally Ann Camper
- Deptartment of Human Genetics, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI 48198-5618, USA
- Correspondence: Sally A. Camper, PhD, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI 48198-5618, United States. E-mail: ; or Maria Ines Perez-Millan, PhD, University of Buenos Aires, Buenos Aires, C1428EHA, Argentina. E-mail:
| | - Maria Ines Pérez-Millán
- Instituto de Biociencias, Biotecnología y Biología Traslacional (IB3), Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Ciudad de Buenos Aires,Argentina
- Correspondence: Sally A. Camper, PhD, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI 48198-5618, United States. E-mail: ; or Maria Ines Perez-Millan, PhD, University of Buenos Aires, Buenos Aires, C1428EHA, Argentina. E-mail:
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