1
|
Murga Valderrama NL, Segura Portocarrero GT, Romani Vasquez AC, Frias Torres H, Flores Durand GJ, Cornejo Villanueva VG, Del Solar JC, Costa Polveiro R, da Silva Vieira D, Bardales Escalante W, Zamora-Huamán SJ, Ordinola-Ramirez CM, Maicelo Quintana JL, Lopez Lapa RM. Exploring the microbiome of two uterine sites in cows. Sci Rep 2023; 13:18768. [PMID: 37907617 PMCID: PMC10618249 DOI: 10.1038/s41598-023-46093-0] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 05/25/2023] [Accepted: 10/27/2023] [Indexed: 11/02/2023] Open
Abstract
Bacterial communities in the mammalian reproductive system can be rich and diverse, differing in structure and quantity depending on location. In addition, its microbiome is associated with the state of health of this tract and reproductive success. This study evaluated the microbiome composition of the uterine body (UB) and uterine horn mucosa (UH) samples using 16S rRNA sequencing of samples extracted from cows in the Amazon region. It was observed that four main phyla were shared between the uterine sites: Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, and Proteobacteria. Linear discriminant analysis effect size and heat tree analysis showed that members of Lachnospiraceae (NK3A20 group) and Oscillospiraceae were significantly more abundant in the UB than in UH. In addition, there are more unique genera in the UB than in the UH. A higher bacterial load in UB than in UH is expected because of the exposure to external factors of UB. However, comparing the site's communities through beta diversity did not generate well-defined clustering. Thus, it can be attributed to the closeness of the sites, which would make the niches similar ecologically and microbiologically. Therefore, this research provides knowledge to understand biomarkers in the prior reproduction period.
Collapse
Affiliation(s)
- Nilton Luis Murga Valderrama
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
- Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Gleni Tatiana Segura Portocarrero
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
- Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Ana Cecilia Romani Vasquez
- Laboratorio de Fisiología Molecular, Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Hugo Frias Torres
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
- Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Gary Jacsel Flores Durand
- Laboratorio de Fisiología Molecular, Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Victor Guillermo Cornejo Villanueva
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
- Laboratorio de Fisiología Molecular, Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Jakson Ch Del Solar
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Richard Costa Polveiro
- Laboratory of Bacterial Diseases, Sector of Preventive Veterinary Medicine and Public Health, Department of Veterinary, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil
| | - Dielson da Silva Vieira
- Basic Medical Sciences, College of Veterinary Medicine, Purdue University, West Lafayette, IN, 47907, USA
- Chemistry Department, Institute for Drug Discovery, Purdue University, West Lafayette, IN, 47907, USA
| | - William Bardales Escalante
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
- Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Segundo José Zamora-Huamán
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
- Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Carla Maria Ordinola-Ramirez
- Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Jorge Luis Maicelo Quintana
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
- Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru
| | - Rainer Marco Lopez Lapa
- Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru.
- Laboratorio de Fisiología Molecular, Instituto de Investigación en Ganadería y Biotecnología, Facultad de Ingeniería Zootecnista, Agronegocios y Biotecnología, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru.
- Facultad de Medicina, Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, Chachapoyas, 01001, Chachapoyas, Peru.
| |
Collapse
|