Polymorphism of mitochondrial DNA in the Brazilian Canindé goat breed

The success of the geographical distribution of goat populations around the world is a consequence of the adaptive potential of these breeds. Several relevant traits to the success of the species in colonizing different ecosystems (and use by man) evolved before domestication. These features were relevant for the selection of different breeds. Each breed represents a genetic heritage that may be unique and essential for maintaining the species. The objective of this study was to catalog the mtDNA haplotypes of the Brazilian autochthonous Canindé goat breed and to characterize the genetic diversity observed in subpopulations by sequencing a 481-bp fragment corresponding to the first portion of the control region in 178 individuals from 10 herds, sampled in six Brazilian states. The global population displays a total of 29 haplotypes and 56 polymorphic sites. About one-third (10) of the haplotypes were common to all subpopulations while the remaining (19) were exclusive to a single subpopulation. The population exhibited high average haplotype diversity (0.82), with maximum and minimum values of 0.90 and 0.56 in individual subpopulations, respectively. In contrast, nucleotide diversity was 0.014, with maximum and minimum values of 0.020 and 0.004, respectively. The spatial analysis of molecular variance did not detect structure within the Canindé goat breed, and analysis of molecular variance revealed that 88.4% of the variation observed in the population was due to differences among individuals in the same subpopulation. Only 11.4% of the genetic variation referred to differences among subpopulations. About one-third (33.1%) of the individuals within population shared the same haplotype, which may be due not only to the breed developing from a small number of matrilines. The Brazilian autochthonous Canindé breed was classified as haplogroup A, a haplotype predominant in the Europe region.

Genetic diversity and patterns of population structure in Creole goats from the Americas

Biodiversity studies are more efficient when large numbers of breeds belonging to several countries are involved, as they allow for an in-depth analysis of the within- and between-breed components of genetic diversity. A set of 21 microsatellites was used to investigate the genetic composition of 24 Creole goat breeds (910 animals) from 10 countries to estimate levels of genetic variability, infer population structure and understand genetic relationships among populations across the American continent. Three commercial transboundary breeds were included in the analyses to investigate admixture with Creole goats. Overall, the genetic diversity of Creole populations (mean number of alleles = 5.82 ± 1.14, observed heterozygosity = 0.585 ± 0.074) was moderate and slightly lower than what was detected in other studies with breeds from other regions. The Bayesian clustering analysis without prior information on source populations identified 22 breed clusters. Three groups comprised more than one population, namely from Brazil (Azul and Graúna; Moxotó and Repartida) and Argentina (Long and shorthair Chilluda, Pampeana Colorada and Angora-type goat). Substructure was found in Criolla Paraguaya. When prior information on sample origin was considered, 92% of the individuals were assigned to the source population (threshold q ≥ 0.700). Creole breeds are well-differentiated entities (mean coefficient of genetic differentiation = 0.111 ± 0.048, with the exception of isolated island populations). Dilution from admixture with commercial transboundary breeds appears to be negligible. Significant levels of inbreeding were detected (inbreeding coefficient > 0 in most Creole goat populations, P < 0.05). Our results provide a broad perspective on the extant genetic diversity of Creole goats, however further studies are needed to understand whether the observed geographical patterns of population structure may reflect the mode of goat colonization in the Americas.

Genetic relationship between the Nordestino horse and national and international horse breeds

Knowledge of genetic diversity and relationships between breeds is very important for conservation programs. Hair samples were collected from 393 individual Nordestino horses and genotyped using 14 microsatellite markers in order to investigate the genetic relationship between this breed and 66 international horse breeds. There was high allelic diversity and inbreeding coefficient within population values were not significant, which was probably due to crossbreeding. Despite the Nordestino horse population being in Hardy-Weinberg equilibrium, a global deficit of heterozygotes was observed. This may represent evidence of repeated use of the same stallions for breeding, which is consistent with the high number of castrated males found. Campolina, Mangalarga Marchador, and Mangalarga were the Brazilian horse breeds most closely related to the Nordestino horse, which is a reflection of recent introgressions. Among Iberian horse breeds, the Sorraia breed appears to have had an important influence on the genetics of the Nordestino horse. Those results provide important information that can guide future conservation programs.

Zoometria como ferramenta de caracterização morfoestrutural genética em fêmeas da raça Sindi no Brasil

Este trabalho foi executado com a finalidade de acrescentar elementos objetivos na avaliação das diferenças genéticas entre as duas bases conhecidas da raça Sindi no Brasil. Para isso, realizou-se a caracterização zoométrica de vacas Sindi utilizando medidas cranianas, morfoestruturais e índices corporais de fêmeas adultas de cinco rebanhos formados a partir das duas bases. Os dados foram submetidos a uma análise de variância e teste de médias (Tukey, 5 % de probabilidade) e posteriormente a uma análise multivariada de componentes principais. Verificou-se diferença estatística significante entre as médias obtidas para a maioria das características estudadas, principalmente nas medidas morfoestruturais e nos índices corporais, demonstrando claramente a formação de grupos distintos em relação à base de formação genética dos rebanhos, o que sugere a presença de duas linhas genéticas distintas da raça no Brasil.

Diversidade genética e estrutura populacional de subpopulações remanescentes da raça equina nordestino

O presente trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura e diversidade genética de quatro subpopulações do cavalo Nordestino utilizando 14 marcadores microssatélites. Amostras de bulbo capilar de 393 cavalos foram coletadas, distribuídos em: 61 animais do vale do Salitre (JUAZ-BA) localizado no estado da Bahia, 89 das mesorregiões Norte e Centro-Norte do estado do Piauí, 58 animais da cidade de Agrestina (AGRE-PE) e 185 das mesorregiões Sertão e Sertão do São Francisco localizado no estado de Pernambuco (SERT-PE). A diversidade genética, diferenciação genética e efeito de gargalo genético foram avaliados nas 4 subpopulações do cavalo Nordestino. Observou-se elevada diversidade genética e valores de Fis que não evidenciaram níveis de consanguinidade significativa, prova-velmente isso se deve à acasalamentos entre as subpopulações. Efeito de gargalo genético recente não foi detectado para as quatro subpopulações, porém os modelos IAM e TPM sugeriram um efeito de gargalo genético não recente. Isso pode ser reflexo da redução no número de reprodutores decorrente da castração de machos, processo de mecanização e mudanças no estilo de vida das populações da zona rural. Eventos mais antigos do efeito de gargalo genético não foram suficientes para evidenciar uma diferenciação genética entre as 4 subpopulações, portanto elas formam um só grupo genético.

Perfil fenotípico do remanescente do cavalo nordestino no nordeste do brasil

O presente trabalho teve como objetivo caracterizar o perfil fenotípico do remanescente do Cavalo Nordestino nos estados de Pernambuco e Piauí, no Nordeste do Brasil. Foram avaliados 238 animais entre machos, fêmeas e machos castrados, através de caracteres morfológicos qualitativos (perfil de chanfro, justaposição dos lábios, forma do pescoço, inclinação de garupa) e fanerópticos (coloração da pelagem, coloração dos cascos anteriores e posteriores e tamanho dos cascos). Foi realizada estatística de distribuição de freqüência para todas as variáveis estudadas. Em relação à coloração da pelagem, para os animais de Pernambuco, houve uma maior predominância da tordilha e castanha, para os animais do Piauí as pelagens tordilha e baia. Para o perfil de chanfro o mais freqüente foi o sub-convexo, depois o retilíneo nos animais avaliados no estado de Pernambuco, o sub-côncavo foi mais presente nos machos do Piauí. A forma do pescoço mais freqüente foi a piramidal, com exceção do tipo cervo para as fêmeas e castrados do Piauí. A coloração dos cascos dos anteriores e posteriores apresentou uma predominância da coloração escura ou preta e depois a rajada. Ocorreu uma maior freqüência dos cascos de tamanho pequenos, com exceção para os machos inteiros e castrados de Pernambuco, com predominância de cascos de tamanho médio. Os animais de Pernambuco apresentaram uma maior freqüência dos lábios firmes e justapostos, para os animais machos e machos castrados do Piauí os lábios justapostos, e com as fêmeas os lábios relaxados, ocorrendo em todas as classes dos animais a presença de lábios relaxado ou belfos. Com relação a inclinação de garupa, observou-se maior freqüência para as formas derreadas e inclinadas, com exceção dos machos inteiros de Pernambuco que apresentaram maior freqüência de garupa ligeiramente inclinada, que atende ao padrão do Cavalo Nordestino.

Genetic and environmental effects on age at first farrowing in sows in southeastern Brazil

We evaluated genetic and environmental factors affecting age at first farrowing of sows in the Brazilian southeast. For this purpose, 466 observations regarding the age at first farrowing were made for Dalland-C40© animals belonging to two herds. The effects of the environmental factors on this trait were assessed by means of a model that included, as random effects, the influence of the sow's father and mother and, as fixed effects, the influence the year of birth, the herd and the birth season, along with the covariable litter size at birth. The variance components were estimated using the derivative-free restricted maximum likelihood method. The estimated mean was 354.8 ± 25.87 days, with a coefficient of variation of 7.29%. Significant effects on the trait were observed for the herd, the year and the season of birth; but a linear effect of litter size at birth on the age at first farrowing was not observed. The boar did not significantly contribute to the variation occurring among the sows, whereas the sow's mother caused significant variation. The heritability estimate for the age at first farrowing was 0.44 ± 0.15, which is considered high. We concluded that herd effect and year and season of birth should be taken into consideration for an accurate genetic comparison; consequently, the animals should be joined into contemporary groups.

Drift across the Atlantic: genetic differentiation and population structure in Brazilian and Portuguese native goat breeds

Brazilian goat breeds are believed to derive mainly from animals brought by Portuguese settlers since the 16th century. We used microsatellite markers in a sample of 436 animals to study genetic variability and differentiation of the six Portuguese (PT) and six Brazilian (BR) goat breeds currently recognized in the two countries. These breeds were also compared with an outgroup represented by a sample of Alpine (ALP) goats. The effective number of alleles and allelic richness were slightly higher in PT than in BR breeds. The global F(ST) was nearly 0.11 when PT and BR breeds were considered, with a mean pairwise F(ST) of about 0.03 among PT breeds, 0.07 among BR breeds and 0.15 between PT and BR breeds. The dendrogram illustrating relationships between populations and the correspondence analysis indicate the existence of two very distinct clusters, corresponding to the countries of origin of the breeds studied, which are nearly equidistant from the Alpine outgroup. The analysis with structure confirmed the separation between PT and BR breeds but suggests that some BR breeds, especially Graúna and Canindé, may share a common ancestry with PT breeds. The divergence observed between PT and BR breeds may result from founder effects and genetic drift but could also reflect the introduction in Brazil of goats originating from other regions, e.g., West Africa.

Polimorfismo genético da leptina e do receptor do hormônio do crescimento em caprinos

Objetivou-se estudar a relação entre o polimorfismo no gene da leptina (LEP), especi-ficamente o éxon 2, e o microssatélite do receptor do hormônio do crescimento (SSR-GHR) com as características de crescimento em animais das raças Anglo-Nubiana e Boer, a fim de identificar marcadores que possam ser úteis na seleção desses animais da espécie caprina de elevado mérito genético. Foram obtidas as frequências alélicas e heterozigosidade com auxílio do programa Toolkit. O teste para o equilíbrio de Hardy-Weinberg foi feito com auxílio do GENEPOP, no qual os marcadores se mostraram em desequilíbrio para as populações. Para a LEP os valores de heterozigosidade observada foram bem maiores do que os esperados e todos os animais apresentaram o mesmo padrão eletroforétrico com dois alelos (150 e 152 pb). No loco do GHR observou-se cinco alelos com tamanho variando de 90 a 125 pb. Para verificar a influência dos genótipos dos fragmentos polimórficos do GHR e da leptina sobre o desenvolvimento dos animais foram utilizados os pesos ao nascer (PN) e ao desmame (PD), para os quais foi feito análise de variância e teste de médias com auxílio do procedimento GLM do programa SAS. Observou-se efeito significativo dos genótipos sobre os pesos ao nascer (PN) e à desmame (PD). Sugere-se, o estudo destes polimorfismos em maior número de animais para confirmação do efeito sobre características de crescimento.

Conhecimento local e produção animal: uma perspectiva baseada na etnozootecnia

Este artigo tem como objetivo principal estabelecer um marco teórico e conceitual para a investigação etnozootécnica, situando-a no contexto das relações homem-animal-meio. Visa também descrever e analisar historicamente as relações da etnozootecnia com a própria zootecnia em geral e com outros ramos mais específicos do conhecimento como a etnologia zootécnica e a etnologia humana. A investigação etnocientífica é um entre muitos caminhos para registrar e compreender o conhecimento local, inclusive aquele relativo aos recursos naturais. Entre as abordagens etnocientíficas destaca-se, neste sentido, a etnozootecnia. Esta é compreendida aqui como uma abordagem etnocientífica dedicada à realização de estudos interdisciplinares a respeito dos conhecimentos, práticas e crenças das populações humanas (principalmente as rurais) sobre os animais de produção. Um aspecto importante desses estudos é a avaliação das convergências e divergências entre os conhecimentos zootécnicos aceitos pela comunidade científica e aqueles manifestados pelas populações humanas envolvidas nos estudos. Trata-se, portanto, de um conceito mais abrangente, quando comparado com "saber zootécnico local" e com "etnologia zootécnica", embora estes dois temas façam parte do escopo da Etnozootecnia. Fontes documentais indicam que o conhecimento local tem sido, historicamente, uma importante fonte de informações para o avanço da ciência formal relativa aos animais (domésticos e silvestres) e seu manejo. É provável também que o conhecimento zootécnico local, patrimônio acumulado ao longo de muitas gerações, e muitas vezes transmitido apenas por comunicação oral, possa contribuir como fonte importante de subsídios para a formulação de estratégias socialmente apropriadas para o manejo e conservação dos recursos genéticos animais.

Implementation of a systematic approach to diabetes in primary care in Bahia, Brazil improves metabolic outcomes: PRODIBA-Programa de Interiorização da Assistência ao Diabetes na Bahia (Project for Dissemination of Diabetes Care in the State of Bahia)

BACKGROUND

Staged Diabetes Management (SDM) improves glycaemic control and reduces diabetes-related complications in primary care.

METHODS

An 18-month randomized controlled cohort study was conducted in two municipalities in the state of Bahia, Brazil, involving 100 patients with Type 2 diabetes in each municipality. In one municipality, healthcare professionals were trained to use SDM customized protocols for clinical decisions and, in the other municipality, no protocols for diabetes care were implemented. We hypothesized that, in the municipality with SDM trained professionals, patients would have better outcomes, including a fall in glycated haemoglobin (HbA(1c)).

RESULTS

Improvements in some metabolic parameters were observed in the SDM group, including a 22% decrease in mean random glucose, a significant 15% decrease in mean HbA(1c), a 6% decrease in systolic blood pressure and an 11% decrease in diastolic blood pressure. There were no differences in body mass index and lipid profile.

CONCLUSIONS

SDM customized algorithms are effective, practical and easy to use in primary healthcare teams with very limited resources.

Estimativas de parâmetros de curvas de lactação de bovinos

O objetivo deste trabalho foi comparar algumas funções matemáticas citadas na literatura, identificar a que melhor descreve a produção de leite e estimar alguns componentes da curva de lactação de vacas Guzerá e Sindi criadas na região semi-árida do estado da Paraíba. Foram utilizadas 840 lactações (467-Guzerá; 373-Sindi) de animais pertencentes à Fazenda Carnaúba, município de Taperoá, Paraíba. O controle leiteiro foi feito em intervalos de 35 dias, no período de 1987 a 2004. As lactações utilizadas continham no mínimo cinco e no máximo doze controles. O ajuste foi feito para a curva média e para lactações individuais, utilizando-se seis funções matemáticas. A função polinomial inversa (PI), linear hiperbólica (LHE), gama incompleta (GI), quadrática logarítmica (QL), linear (L) e quadrática (Q) foram ajustadas usando-se processos iterativos por meio de regressão não-linear. Os critérios utilizados para verificar a qualidade do ajuste para cada função foram: coeficiente de determinação ajustado (Ra2), percentagem de desvios entre as produções totais observadas e estimadas e percentagem de curvas típicas. Os gráficos de distribuição de resíduos foram utilizados apenas para avaliar o ajuste para a curva média. Para a curva média, os valores de Ra2 foram superiores a 0,93 para todas as funções. Bons ajustes baseados nos Ra2>0,80 foram obtidos, respectivamente, para 61,4% e 66,7% das lactações ajustadas pelas funções PI e GI para vacas Guzerá. Para vacas Sindi, esses valores foram de 57,2% e 55,0%, indicando boa qualidade no ajuste. As funções PI e GI acompanharam mais de perto as oscilações da produção ao longo da lactação. Para curva média, todas as funções poderiam ser utilizadas, pois os desvios foram muito próximos. Para as lactações individuais, melhores estimativas dos componentes da curva de lactação poderiam ser obtidos pelas funções PI e GI.

Análises morfométricas entre apis mellifera da mesorregião do sertão paraibano

Objetivou-se, com esse trabalho, caracterizar as populações de Apis mellifera da mesorregião do Sertão paraibano, comparando os indivíduos morfometricamente. As medidas tomadas foram: comprimento da asa anterior (CAA) e largura da asa anterior (LAA), ângulos B4, E9, G18, J16, K19, N23, O26 e distância b (Db); comprimento da asa posterior (CAP) e largura da asa posterior (LAP), distância L2 (DL2), L5 (DL5) e ângulo W3, comprimento do fêmur (CF), comprimento da tíbia (CT), comprimento do tarso (CTS) e largura do tarso (LTS) e comprimento da probóscide (CP). Para a comparação das diferentes variáveis estudadas utilizou-se a análise de variância, o teste de Tukey, análise canônica e o teste de Tocher a 5% de significância. Para as medidas realizadas em cada amostra utilizou-se um equipamento de análise de imagens, Programa Image Pro Plus 4.0. As variáveis CTS e LTS, ângulos G18 e K19 e DL2 diferiram significativamente (p